More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3982 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
279 aa  569  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
275 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.454392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
274 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000578748  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.13 
 
 
274 aa  175  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.61 
 
 
274 aa  171  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
274 aa  168  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168385  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
274 aa  168  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
294 aa  159  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000507932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.36 
 
 
186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
266 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
257 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
257 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
330 aa  122  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
330 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
276 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
333 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  32.37 
 
 
337 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
347 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
253 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
336 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
246 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  35.29 
 
 
544 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1489  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
266 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
336 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.99 
 
 
246 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
344 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3848  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460239  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
355 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
336 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  31.69 
 
 
261 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.12 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.264514  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
299 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
262 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.05 
 
 
246 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
366 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
258 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1371  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
342 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
246 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
246 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
263 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.50771  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 
342 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
269 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.45 
 
 
254 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.16 
 
 
236 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  33.85 
 
 
269 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
256 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5638  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
342 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6386  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
342 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  0.430331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
258 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
263 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
247 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4069  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
239 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1589  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.05 
 
 
243 aa  106  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.511722  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6050  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 
342 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.057993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 
441 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
328 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6458  short chain dehydrogenase  29.95 
 
 
342 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859122  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
293 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
336 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
334 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
249 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3195  amino acid adenylation domain-containing protein  31.69 
 
 
2031 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
254 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
336 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
254 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
261 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1374  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
343 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3155  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
343 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.94 
 
 
238 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 
244 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3026  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
343 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20190  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
336 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
252 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 
258 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1284  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
343 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.524856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
326 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
255 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.55 
 
 
249 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
255 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
251 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
262 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>