278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0113 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
429 aa  861    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  36.22 
 
 
188 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  32.62 
 
 
339 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  44.3 
 
 
96 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
196 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  41.56 
 
 
79 aa  68.2  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  31.64 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  33.77 
 
 
155 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  26.84 
 
 
186 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2628  ArsR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
192 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000130516  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  34 
 
 
171 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  54.39 
 
 
112 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  37.23 
 
 
171 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
115 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  43.37 
 
 
113 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1099  ArsR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
359 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967799  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  32.35 
 
 
180 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 
221 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  36.99 
 
 
254 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02750  regulatory protein ArsR  48.21 
 
 
97 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  44.59 
 
 
119 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  39.29 
 
 
114 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  38.71 
 
 
171 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  48.21 
 
 
112 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
228 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  36.71 
 
 
89 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
121 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  32.88 
 
 
254 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  41.43 
 
 
120 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  50.88 
 
 
112 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  30.68 
 
 
107 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5186  transcriptional regulator, ArsR family  46.77 
 
 
117 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251574  normal  0.286102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  30.95 
 
 
184 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  41.67 
 
 
96 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  38.75 
 
 
178 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  31.86 
 
 
181 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1154  transcriptional regulator, ArsR family  40.68 
 
 
113 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303698  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 
141 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  38.16 
 
 
148 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1115  hypothetical protein  28.89 
 
 
101 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  31.51 
 
 
254 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  34.38 
 
 
178 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
317 aa  50.4  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2050  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 
104 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824329  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
105 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  36.51 
 
 
95 aa  50.4  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  41.07 
 
 
92 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
95 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0344  transcriptional regulator, ArsR family  37.93 
 
 
118 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  36.51 
 
 
95 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.78 
 
 
305 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1233  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
123 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
95 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0559  regulatory protein, ArsR  35.11 
 
 
123 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0567484  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
226 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  32.2 
 
 
181 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  44.64 
 
 
94 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
226 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 
125 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
130 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4676  ArsR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
90 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2391  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  41.11 
 
 
106 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  36.05 
 
 
110 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  43.06 
 
 
130 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4988  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
96 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4586  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
90 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0976523  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 
110 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
112 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0274  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
90 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  40.91 
 
 
223 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4960  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
90 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2300  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
99 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.290076  hitchhiker  0.000322902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
127 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.07 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
119 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  36 
 
 
349 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4878  transcriptional regulator, TrmB  42.86 
 
 
109 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 
110 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
119 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  33.33 
 
 
111 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  29.11 
 
 
95 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
110 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  38.33 
 
 
306 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 
342 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
223 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 
218 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>