281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3988 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  751    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  65.5 
 
 		 375 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  65.5 
 
 		 372 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  58.76 
 
 		 372 aa  435  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  57.95 
 
 		 372 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  56.06 
 
 		 377 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  49.32 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  45.92 
 
 		 371 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  46.07 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  42.74 
 
 		 371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  44.81 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  43.44 
 
 		 373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  45.66 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.19 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  42.05 
 
 		 373 aa  292  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  40.97 
 
 		 373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  41.78 
 
 		 373 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  41.24 
 
 		 373 aa  288  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  40.49 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.24 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  40.97 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  40.97 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  40.97 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  40.7 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  41.19 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  40.43 
 
 		 373 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  42.32 
 
 		 373 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  41.82 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  40.55 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  38.11 
 
 		 373 aa  252  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  42.73 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  40.06 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  37.1 
 
 		 369 aa  239  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  37.84 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  35.05 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  38.36 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  35.58 
 
 		 393 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  35.92 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  38.28 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  37.5 
 
 		 379 aa  226  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  38.14 
 
 		 366 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  36.95 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  36.14 
 
 		 365 aa  210  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  36.45 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  34.34 
 
 		 364 aa  206  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  39.06 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  32.95 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  35.81 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  34.86 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  32.08 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  32.08 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  34.94 
 
 		 380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  35.63 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  35.58 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  35.58 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  35.58 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  35.79 
 
 		 373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  35.39 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  41.36 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  35.71 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  31.05 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  28.01 
 
 		 386 aa  136  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  31.3 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  30.6 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  37.88 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  41.94 
 
 		 264 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  38.66 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  34.72 
 
 		 255 aa  101  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  34.62 
 
 		 274 aa  96.7  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  29.36 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  27.79 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  47.06 
 
 		 103 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  27.38 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  37.8 
 
 		 307 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  44 
 
 		 103 aa  92.8  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2994  hypothetical protein  42.72 
 
 		 108 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  46.08 
 
 		 105 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  37.4 
 
 		 269 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  34.62 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  47.96 
 
 		 106 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  34.62 
 
 		 262 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  90.9  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  36.08 
 
 		 296 aa  90.1  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15770  hypothetical protein  42.16 
 
 		 105 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170868 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  37.1 
 
 		 262 aa  89.4  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  37.9 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1356  hypothetical protein  41.18 
 
 		 105 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.39818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  43.14 
 
 		 103 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1038  hypothetical protein  44 
 
 		 103 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  43 
 
 		 103 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  43 
 
 		 103 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  34.13 
 
 		 287 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.8 
 
 		 318 aa  87  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  42 
 
 		 103 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  35.2 
 
 		 310 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  39.06 
 
 		 255 aa  86.7  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  37.9 
 
 		 265 aa  85.9  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  34.43 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39650  hypothetical protein  41 
 
 		 105 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>