69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2335 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2335  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  827    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  39.65 
 
 		 404 aa  259  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  36.01 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0127  hypothetical protein  30.56 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  29.51 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  28.82 
 
 		 439 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1569  hypothetical protein  34.21 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0384  ATP-grasp enzyme-like  28.04 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0958371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0579  ATP-grasp enzyme-like protein  26.09 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  32.14 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  26.42 
 
 		 385 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0698  protein of unknown function DUF201  25.13 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  26.92 
 
 		 410 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  31.35 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  24.69 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1574  protein tyrosine phosphatase  29.25 
 
 		 695 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.354937  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  28.48 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1176  hypothetical protein  24.4 
 
 		 418 aa  99.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356654  hitchhiker  0.00556122 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  29.57 
 
 		 393 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  28.62 
 
 		 439 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8506  hypothetical protein  26.6 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0307347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  28.8 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  24.09 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  23.1 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  32.84 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  27.59 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  26.32 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  22.52 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  24.07 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1270  protein of unknown function DUF201  26.02 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.462862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  25.89 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  24.44 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  28.68 
 
 		 753 aa  66.6  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  33 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  24.68 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  25.36 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  25.33 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  25.33 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  23.12 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  24.56 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  27.86 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  22.67 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  22.18 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  21.02 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  23.12 
 
 		 513 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.15 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4422  hypothetical protein  28.33 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.305337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  28.44 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  24.82 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3857  protein of unknown function DUF201  26.06 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.214933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.72 
 
 		 327 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.09 
 
 		 327 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  24.11 
 
 		 355 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.54 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  25.35 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  23.14 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  22.5 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  22.5 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  26.09 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  22.5 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  25.6 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  22.5 
 
 		 360 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3255  protein of unknown function DUF201  24.26 
 
 		 327 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  24.48 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  25.36 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2392  putative carbamoylphosphate synthase large subunit short form  22.83 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000165669  hitchhiker  0.0000484341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  25.79 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4794  protein of unknown function DUF201  23.14 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  24.8 
 
 		 443 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>