183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0508 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
351 aa  723    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
597 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.65 
 
 
337 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
924 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
528 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
477 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  26.19 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  28.02 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  29.38 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  29.09 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  29.09 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  30.6 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
470 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
470 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
470 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  21.93 
 
 
958 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  27.43 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.15 
 
 
722 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  27.57 
 
 
2046 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 
305 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  27.86 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  27.86 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  25.11 
 
 
470 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 
297 aa  59.3  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
470 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
470 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
753 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
438 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.02 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  23.27 
 
 
331 aa  56.6  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  24.6 
 
 
792 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0697  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.561487  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
513 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  25.68 
 
 
284 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  24.65 
 
 
672 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.15 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
1152 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 
362 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  24.46 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 
289 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  22.86 
 
 
335 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  24.79 
 
 
351 aa  54.7  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  25.56 
 
 
1152 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
315 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
332 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  28.04 
 
 
322 aa  53.5  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
300 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
302 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
345 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  23.19 
 
 
501 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
302 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
336 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  23.67 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  29.79 
 
 
321 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.74 
 
 
2401 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  22.33 
 
 
288 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 
311 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
313 aa  50.4  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  44 
 
 
322 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5657  glycosyl transferase family 2  21.46 
 
 
303 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
306 aa  49.7  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
330 aa  49.7  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
1267 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
487 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  22.36 
 
 
333 aa  49.3  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  25 
 
 
810 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 
444 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
880 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  25.91 
 
 
838 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3773  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
484 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
885 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  24.78 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
753 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09478  putative glycosyltransferase  25.24 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  22.94 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  22.45 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3205  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.159852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>