More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1272 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
306 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
303 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
305 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
528 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  28.88 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
477 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
1486 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  32.7 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.19 
 
 
1644 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.19 
 
 
1644 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 
610 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
470 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
526 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 
487 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.27 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  27.85 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
344 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
344 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.01 
 
 
309 aa  63.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
924 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  32.83 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
470 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
333 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.36 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  28.38 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5657  glycosyl transferase family 2  22.63 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  28.74 
 
 
470 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
513 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  29.33 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 
344 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
996 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  28.38 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
746 aa  59.3  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
531 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 
742 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  31.06 
 
 
322 aa  59.3  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
321 aa  58.9  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
525 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
753 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
733 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 
1759 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
415 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
348 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
725 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
783 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
619 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  32.1 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  23.58 
 
 
358 aa  57  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5508  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164497  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
732 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
1106 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
784 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  28.92 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 
1268 aa  56.2  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1974  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
853 aa  55.8  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
832 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
742 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
430 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  24.02 
 
 
313 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
742 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>