More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4478 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  100 
 
 		 229 aa  440  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  61.54 
 
 		 196 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  76.32 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  83.76 
 
 		 172 aa  214  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  72.11 
 
 		 189 aa  214  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  84.48 
 
 		 197 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  77.44 
 
 		 168 aa  211  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  74.24 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  57.42 
 
 		 195 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  57.42 
 
 		 195 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  79.31 
 
 		 202 aa  207  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  57.42 
 
 		 195 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  82.05 
 
 		 179 aa  207  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  59.69 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  78.69 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  57.67 
 
 		 190 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  79.31 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  81.03 
 
 		 178 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  73.64 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  68.75 
 
 		 203 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  76 
 
 		 195 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  79.31 
 
 		 169 aa  198  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  70.77 
 
 		 176 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  74.19 
 
 		 202 aa  194  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  73.02 
 
 		 164 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  73.39 
 
 		 180 aa  193  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  67.39 
 
 		 181 aa  188  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  73.5 
 
 		 170 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  64.89 
 
 		 144 aa  184  7e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  72.41 
 
 		 183 aa  180  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  65.65 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  67.2 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  63.77 
 
 		 180 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 190 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  59.65 
 
 		 178 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  60.18 
 
 		 175 aa  141  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  60.18 
 
 		 118 aa  141  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  59.46 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 155 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 112 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  58.56 
 
 		 184 aa  138  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  57.27 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  61 
 
 		 144 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 112 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  57.8 
 
 		 137 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 124 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  56.76 
 
 		 127 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 141 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 140 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 114 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  53.54 
 
 		 141 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  53.54 
 
 		 143 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  52.8 
 
 		 140 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  53.57 
 
 		 138 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 141 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  52.76 
 
 		 140 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 142 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  60.4 
 
 		 113 aa  128  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 112 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  59.09 
 
 		 170 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 142 aa  128  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 142 aa  128  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 113 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 113 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 140 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  52.76 
 
 		 140 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  52.54 
 
 		 126 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 117 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 142 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  52.8 
 
 		 140 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  46.9 
 
 		 151 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  55.86 
 
 		 140 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 138 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  56.48 
 
 		 112 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  52.38 
 
 		 138 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 138 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 113 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 120 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 139 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  48.72 
 
 		 138 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2127  50S ribosomal protein L17P  51.72 
 
 		 121 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0812324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 138 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  51.59 
 
 		 141 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>