More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3218 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3218  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
269 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0577102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  75.46 
 
 
269 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  73.13 
 
 
272 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  73.13 
 
 
272 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  73.13 
 
 
272 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  73.13 
 
 
272 aa  367  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  74.91 
 
 
267 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5702  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.38 
 
 
271 aa  363  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344478  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.64 
 
 
272 aa  359  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  75.37 
 
 
286 aa  357  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2509  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.52 
 
 
269 aa  355  3.9999999999999996e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.27 
 
 
282 aa  354  8.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.89 
 
 
269 aa  353  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.27 
 
 
272 aa  343  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.03 
 
 
272 aa  338  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.56 
 
 
268 aa  328  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.94 
 
 
270 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.05 
 
 
274 aa  324  9e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  65.53 
 
 
270 aa  319  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  68.18 
 
 
269 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.3 
 
 
317 aa  315  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  71.86 
 
 
268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.04 
 
 
274 aa  311  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.15 
 
 
271 aa  311  9e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1164  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.34 
 
 
268 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2221  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  69.17 
 
 
270 aa  306  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.54 
 
 
275 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  66.17 
 
 
287 aa  296  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.43 
 
 
274 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.54 
 
 
268 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  61.51 
 
 
260 aa  265  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.98 
 
 
268 aa  254  8e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1682  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.27 
 
 
273 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000484528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.23 
 
 
273 aa  246  3e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1687  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.15 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14890  indole-3-glycerol phosphate synthase  58.87 
 
 
277 aa  201  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.165384  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.79 
 
 
270 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.92 
 
 
295 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.18 
 
 
259 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.32 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.4 
 
 
270 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  43.41 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.47 
 
 
259 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.11 
 
 
271 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.31 
 
 
293 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
257 aa  180  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.31 
 
 
293 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.63 
 
 
269 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.52 
 
 
260 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.1 
 
 
297 aa  178  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.8 
 
 
266 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.17 
 
 
259 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.83 
 
 
258 aa  177  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.84 
 
 
266 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4483  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
272 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249423  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.38 
 
 
296 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5475  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.15 
 
 
269 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.78 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06390  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.73 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.77 
 
 
259 aa  172  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.36 
 
 
275 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.15 
 
 
262 aa  171  7.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.74 
 
 
261 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.26 
 
 
295 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44 
 
 
295 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.4 
 
 
294 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  44.18 
 
 
288 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.54 
 
 
268 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  46.39 
 
 
263 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.54 
 
 
268 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.2 
 
 
285 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.28 
 
 
287 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422132  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.47 
 
 
272 aa  168  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1800  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.88 
 
 
271 aa  168  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000789952  normal  0.147475 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.15 
 
 
257 aa  168  9e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.7 
 
 
269 aa  168  9e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.86 
 
 
265 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.35 
 
 
266 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.7 
 
 
266 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  38.52 
 
 
261 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  38.11 
 
 
268 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.2 
 
 
269 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.87 
 
 
269 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.58 
 
 
258 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.58 
 
 
258 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.78 
 
 
265 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
263 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.58 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.35 
 
 
263 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.35 
 
 
263 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2155  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.64 
 
 
260 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.209706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.17 
 
 
267 aa  165  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.84 
 
 
266 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0373  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.23 
 
 
259 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.18 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.11 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1733  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.83 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4894  indole-3-glycerol-phosphate synthase  32.68 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>