119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3154 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3154  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 224 aa  381  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  40.14 
 
 		 274 aa  95.5  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  44.38 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  40.46 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  40.44 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  40.74 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  41.84 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  45.74 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  42.69 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  43.53 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  42.13 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  36.84 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  38.36 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  41.13 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  40.29 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  46.15 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  42.21 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  44.53 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  38.46 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  31.91 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4975  peptidase A24A prepilin type IV  39.2 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  31.01 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  40.62 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  32.85 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  39.16 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  35.66 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  33.33 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1219  late competence protein comC  33.04 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1197  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  33.04 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1318  late competence protein comC  33.04 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1395  late competence protein comC  33.04 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  31.76 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  31.58 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  30.7 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  36.52 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  34.02 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  40.8 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  31.31 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15430  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  36.69 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  36.55 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  30.24 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1136  peptidase A24A domain-containing protein  39.26 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  29.75 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  34.86 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  35.56 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  30.66 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3987  late competence protein comC  29.93 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  29.61 
 
 		 289 aa  52  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  33.66 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.43 
 
 		 283 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  34.97 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  34.93 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  34.97 
 
 		 303 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  36.6 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  31.76 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  28.65 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.97 
 
 		 303 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  34.97 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  31.3 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  33.71 
 
 		 283 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  33.09 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  25.82 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  38.37 
 
 		 293 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.67 
 
 		 288 aa  48.9  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  29.85 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  31.58 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  26.03 
 
 		 263 aa  48.5  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05160  type IV leader peptidase  38.97 
 
 		 167 aa  48.5  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.211202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.83 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  33.11 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  32.98 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  32.8 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  34.25 
 
 		 303 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3139  peptidase A24A prepilin type IV  44.7 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.06 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.4 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  32.4 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  30 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  30 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  39.86 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  30.05 
 
 		 294 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3404  peptidase A24A prepilin type IV  39.78 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  24.73 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1357  late competence protein comC  29.01 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2211  peptidase A24A prepilin type IV  40.65 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144961  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5256  peptidase A24A prepilin type IV  41.38 
 
 		 194 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.652465  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1719  hypothetical protein  39.33 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135508  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  34.06 
 
 		 266 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  34.06 
 
 		 266 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  40.66 
 
 		 255 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  34.62 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  35.53 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0304  prepilin peptidase  40.56 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.194253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  28.57 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  27.65 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  30.53 
 
 		 303 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  36.42 
 
 		 306 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  41.43 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  31.06 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>