More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2857 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
311 aa  627  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.1 
 
 
314 aa  320  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.63 
 
 
311 aa  292  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.28 
 
 
317 aa  288  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.6 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.69 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.56 
 
 
276 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.01 
 
 
285 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
310 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
287 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
302 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.2 
 
 
241 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
311 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
283 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
283 aa  104  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.89 
 
 
193 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
291 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 
241 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.76 
 
 
245 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.74 
 
 
310 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
245 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.8 
 
 
249 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  29.25 
 
 
241 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.57 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3781  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  0.079613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1096  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
250 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 
327 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0798  hypothetical protein  21.82 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.64 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  28.11 
 
 
292 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  21.94 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.978528  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  26.37 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  32.84 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  31.34 
 
 
289 aa  63.2  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  27.89 
 
 
317 aa  62.4  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  31.34 
 
 
289 aa  62.8  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.23 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.05 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.45 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  29.97 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.53 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  18.51 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.78 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  24.53 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.29 
 
 
317 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  24.53 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  24.53 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  24.53 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  25.08 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.87 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  25.08 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.08 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.27 
 
 
286 aa  60.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  24.53 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248411  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  26.84 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.7 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  33.9 
 
 
283 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  24.21 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.57 
 
 
305 aa  59.3  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.12 
 
 
314 aa  59.7  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
309 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 
274 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  24.22 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>