127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2682 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2682  20S proteasome A and B subunits  100 
 
 		 280 aa  557  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2645  proteasome subunit beta  64.06 
 
 		 283 aa  334  7.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  65.13 
 
 		 276 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  61.39 
 
 		 279 aa  325  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  63.53 
 
 		 324 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  66.4 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2176  proteasome subunit beta  63.6 
 
 		 275 aa  316  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00215811  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  61.98 
 
 		 285 aa  314  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22030  proteasome endopeptidase complex, beta component  57.69 
 
 		 289 aa  313  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00409578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2241  20S proteasome A and B subunits  58.78 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0213525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  57.93 
 
 		 288 aa  312  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  60.54 
 
 		 273 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  61.3 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  61.24 
 
 		 304 aa  302  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  59.85 
 
 		 274 aa  298  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  61.09 
 
 		 288 aa  291  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  56.13 
 
 		 284 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  53.05 
 
 		 280 aa  285  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  56.37 
 
 		 282 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  58.56 
 
 		 292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  55.17 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  58.02 
 
 		 270 aa  279  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  55.56 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  55.56 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  55.56 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  55.08 
 
 		 306 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  53.33 
 
 		 302 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  56.13 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1204  20S proteasome A and B subunits  53.36 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.101422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  54.02 
 
 		 273 aa  261  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2238  20S proteasome A and B subunits  56.44 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12142  proteasome beta subunit prcB  56.27 
 
 		 291 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000259602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1015  20S proteasome, A and B subunits  52.06 
 
 		 282 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.410005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  48.36 
 
 		 282 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  55.36 
 
 		 273 aa  247  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2442  20S proteasome A and B subunits  51.12 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000142562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  32.23 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  34.43 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  28.05 
 
 		 219 aa  88.6  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  29.85 
 
 		 211 aa  85.9  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  29.41 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  29.41 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  31.15 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  28.51 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  29.73 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  29.67 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  28.11 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  29.12 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  30.22 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  27.47 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  32.11 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  26.81 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  24.43 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  27.32 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.61 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  31.15 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.03 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  28 
 
 		 243 aa  57  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  26.32 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  28.16 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  25.82 
 
 		 198 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  27.84 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  25.14 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  24.21 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  28.09 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  24.74 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  27.87 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  30.51 
 
 		 187 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  25 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  22.75 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  23.94 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  33.33 
 
 		 178 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  33.33 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  25 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0043  ATP-dependent protease peptidase subunit  34.72 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  35.21 
 
 		 181 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3707  ATP-dependent protease peptidase subunit  34.72 
 
 		 178 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  21.97 
 
 		 199 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3384  ATP-dependent protease peptidase subunit  34.72 
 
 		 178 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  25.73 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  22.6 
 
 		 233 aa  45.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  37.14 
 
 		 180 aa  45.4  0.0009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  27.57 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  27.38 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  27.53 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  31.94 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  29.45 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3254  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.43 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6441  ATP-dependent protease peptidase subunit  31.94 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2477  ATP-dependent protease peptidase subunit  31.94 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3138  ATP-dependent protease peptidase subunit  31.94 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.43 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.43 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.43 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.43 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.43 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  38.24 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3086  ATP-dependent protease peptidase subunit  31.94 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0495645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3108  ATP-dependent protease peptidase subunit  31.94 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192963 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3000  ATP-dependent protease peptidase subunit  31.94 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>