263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3599 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.81 
 
 		 190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.16 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.69 
 
 		 186 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.46 
 
 		 184 aa  279  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.58 
 
 		 176 aa  270  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.73 
 
 		 193 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.51 
 
 		 206 aa  268  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  75 
 
 		 176 aa  268  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.88 
 
 		 184 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.84 
 
 		 189 aa  265  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.63 
 
 		 182 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.32 
 
 		 184 aa  264  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.88 
 
 		 186 aa  264  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.73 
 
 		 189 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.59 
 
 		 187 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.86 
 
 		 182 aa  261  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.42 
 
 		 184 aa  261  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.89 
 
 		 182 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.78 
 
 		 186 aa  261  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.83 
 
 		 193 aa  260  8e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.94 
 
 		 175 aa  255  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  71.68 
 
 		 183 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.93 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.23 
 
 		 184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.42 
 
 		 191 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.79 
 
 		 188 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.15 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.58 
 
 		 182 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.68 
 
 		 197 aa  247  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.14 
 
 		 199 aa  244  6e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.97 
 
 		 182 aa  242  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.19 
 
 		 177 aa  241  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.94 
 
 		 175 aa  241  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 185 aa  240  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.39 
 
 		 182 aa  240  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.24 
 
 		 204 aa  240  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.24 
 
 		 181 aa  239  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 189 aa  239  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 187 aa  238  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.79 
 
 		 185 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 		 186 aa  238  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 		 184 aa  238  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.21 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 		 178 aa  235  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.84 
 
 		 176 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 		 188 aa  234  6e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.05 
 
 		 185 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 176 aa  232  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 		 178 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.8 
 
 		 189 aa  231  5e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.31 
 
 		 194 aa  230  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 		 178 aa  230  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.17 
 
 		 181 aa  230  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.37 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.92 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.41 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 		 183 aa  228  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 185 aa  228  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.09 
 
 		 174 aa  227  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.74 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 172 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  225  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.36 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.59 
 
 		 193 aa  225  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.5 
 
 		 183 aa  224  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.22 
 
 		 183 aa  224  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  61.49 
 
 		 180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 172 aa  224  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 174 aa  224  7e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  64.91 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.05 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  64.91 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.05 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.05 
 
 		 176 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 		 184 aa  223  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  69.23 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.23 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 174 aa  222  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 174 aa  222  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 174 aa  222  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 174 aa  222  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  222  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 176 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  221  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>