236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2376 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  100 
 
 
210 aa  408  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2210  methyltransferase type 11  39.68 
 
 
203 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2862  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
207 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3244  methyltransferase type 11  39.49 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596392  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5739  methyltransferase type 11  39 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19610  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.97 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0633091  normal  0.0668245 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  32.99 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  31.07 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  34.64 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  34.64 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  32.72 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  32.72 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  32.72 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  32.91 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
239 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  28.22 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  32.34 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  28.75 
 
 
250 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 
199 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
327 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
275 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
244 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  28.76 
 
 
246 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.53 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0767  Methyltransferase type 11  32.42 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.763548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  26.28 
 
 
242 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  37.7 
 
 
328 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 
335 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.28 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 
273 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  27.98 
 
 
244 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.57 
 
 
239 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
281 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
276 aa  51.6  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
261 aa  51.6  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.04 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
269 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  34.11 
 
 
349 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  34.11 
 
 
354 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
266 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 
309 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
265 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  34.81 
 
 
342 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.58 
 
 
305 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  44.93 
 
 
331 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  33.04 
 
 
274 aa  49.3  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  51.92 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 
266 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  34.43 
 
 
360 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
250 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 
295 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 
284 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
257 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
706 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29 
 
 
258 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  34.85 
 
 
347 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  26.67 
 
 
241 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
310 aa  48.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
295 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
341 aa  48.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
339 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 
317 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  30.94 
 
 
262 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  25 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
341 aa  47  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.95 
 
 
268 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.56 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
279 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  25 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
341 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  26.77 
 
 
287 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
337 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2642  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
275 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0180  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
282 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
296 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 
271 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
187 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
261 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  32.19 
 
 
349 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  32.31 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2318  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0735638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>