204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0282 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 135 aa  261  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  54.26 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  53.44 
 
 		 137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  50.77 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  48.46 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  48.46 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  48.09 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  46.56 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  49.59 
 
 		 133 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  47.29 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  49.59 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  50.77 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  46.56 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  44.7 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  44.96 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  51.79 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  50.91 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  42.75 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  43.18 
 
 		 333 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  56.67 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  50.75 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  51.35 
 
 		 181 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  48.7 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  41.67 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  43.07 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  43.51 
 
 		 135 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  40.94 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  48.33 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  42.31 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  41.44 
 
 		 170 aa  87  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  42.31 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  42.31 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  42.31 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  42.31 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  42.31 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  42.31 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  44.07 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  48.51 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2291  propanediol utilization protein, PduO  43.08 
 
 		 335 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  40.65 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  35.11 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  43.12 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1736  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  37.1 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2220  PduO  40.46 
 
 		 336 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.616244 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2273  hypothetical protein  40.46 
 
 		 336 aa  80.5  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2386  hypothetical protein  40.77 
 
 		 336 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2173  PduO  40.46 
 
 		 336 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  39.39 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.15 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  39.68 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  41.18 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  43.33 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  40.3 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2227  hypothetical protein  39.69 
 
 		 336 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  38.76 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  40.46 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  38.64 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  40.3 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  39.69 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  42.64 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  41.54 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  41.18 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  41.18 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.74 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2199  hypothetical protein  45.13 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242427  normal  0.47542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  42.34 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2015  hypothetical protein  42.34 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  36.09 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  38.98 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  38.98 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  39.64 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  39.64 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  33.85 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  39.64 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  42.74 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  39.64 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  39.64 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  39.64 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  39.64 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  37.29 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2156  hypothetical protein  42.34 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0998153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  42.74 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  39.26 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  45.19 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  45.19 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  39.42 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  38.76 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  40.59 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  34.35 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1179  hypothetical protein  42.73 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.459415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1010  hypothetical protein  42.73 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000124371  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  42.02 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>