76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2043 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  100 
 
 		 2604 aa  5334    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  37.76 
 
 		 5517 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  34.06 
 
 		 5544 aa  349  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  40.17 
 
 		 1337 aa  335  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  40.17 
 
 		 1337 aa  335  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  31.02 
 
 		 2990 aa  310  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  35.45 
 
 		 5203 aa  281  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  33.86 
 
 		 5166 aa  276  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  32.07 
 
 		 3373 aa  233  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  43.23 
 
 		 1153 aa  211  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  43.23 
 
 		 1153 aa  211  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  29.76 
 
 		 2656 aa  205  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1727 aa  202  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  36.86 
 
 		 1263 aa  196  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  30.56 
 
 		 2047 aa  193  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  33.12 
 
 		 8918 aa  179  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1665 aa  171  1e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  34.32 
 
 		 733 aa  167  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  28.57 
 
 		 2112 aa  163  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  31.6 
 
 		 2876 aa  161  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  30.11 
 
 		 2890 aa  149  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  42.92 
 
 		 965 aa  145  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  42.92 
 
 		 965 aa  145  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  36.9 
 
 		 892 aa  135  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  39.08 
 
 		 3324 aa  131  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  29.63 
 
 		 1243 aa  125  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  25.6 
 
 		 733 aa  102  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2042  hypothetical protein  33.21 
 
 		 322 aa  102  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0353379  normal  0.0145455 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  24.04 
 
 		 1531 aa  99.8  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  26.94 
 
 		 586 aa  99.8  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  29.7 
 
 		 666 aa  95.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  30 
 
 		 3634 aa  93.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  31.27 
 
 		 436 aa  93.2  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  42.11 
 
 		 453 aa  92.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  29.73 
 
 		 2078 aa  91.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  32.28 
 
 		 1989 aa  89.4  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  30.77 
 
 		 2912 aa  84.7  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  25.91 
 
 		 1519 aa  75.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  40 
 
 		 456 aa  75.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  28.5 
 
 		 3486 aa  74.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3984  hypothetical protein  24.73 
 
 		 742 aa  71.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580722  hitchhiker  0.00476383 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08116  hypothetical protein  37.14 
 
 		 281 aa  70.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.627958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2055  hypothetical protein  40.34 
 
 		 214 aa  68.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08111  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  68.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533353  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  25.1 
 
 		 3920 aa  63.9  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.54 
 
 		 4896 aa  63.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1809 aa  62.8  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1990  hypothetical protein  25.16 
 
 		 330 aa  62  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  33.17 
 
 		 1150 aa  60.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0401  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1213 aa  59.7  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.051931  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1537 aa  58.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6957  hypothetical protein  33.63 
 
 		 372 aa  55.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  38.67 
 
 		 130 aa  53.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.37 
 
 		 753 aa  53.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  41.03 
 
 		 440 aa  53.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  29.49 
 
 		 870 aa  53.5  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3603  hypothetical protein  25.68 
 
 		 619 aa  53.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1282  Cna B domain-containing protein  36.28 
 
 		 248 aa  53.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.204415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.03 
 
 		 502 aa  52.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  25.57 
 
 		 1168 aa  52  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1504 aa  52.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0868  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.96 
 
 		 456 aa  51.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  33.12 
 
 		 917 aa  50.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.67 
 
 		 1336 aa  50.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1004  carbonic anhydrase  40.54 
 
 		 436 aa  49.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0975  Carbonate dehydratase  40.54 
 
 		 436 aa  49.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  27.01 
 
 		 382 aa  49.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3250  CG2839  24.31 
 
 		 231 aa  49.3  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  28.83 
 
 		 727 aa  49.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4592  pseudouridine synthase  25.59 
 
 		 624 aa  48.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.667434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6955  hypothetical protein  28.03 
 
 		 396 aa  48.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  18.67 
 
 		 754 aa  48.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6956  hypothetical protein  30.77 
 
 		 280 aa  47.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0130  hypothetical protein  39.19 
 
 		 265 aa  47.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  21.36 
 
 		 1804 aa  46.2  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  30.71 
 
 		 501 aa  46.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>