More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1663 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1663  major facilitator transporter  100 
 
 		 385 aa  743    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.742042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0991  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00118055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.97 
 
 		 483 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.14 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.84 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.8 
 
 		 475 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  27.54 
 
 		 442 aa  113  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  27.29 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  32.04 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.08 
 
 		 513 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 464 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.41 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 455 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 459 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.94 
 
 		 474 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.48 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.79 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.56 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 459 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.78 
 
 		 493 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 459 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 463 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.62 
 
 		 474 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 480 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.77 
 
 		 527 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.97 
 
 		 527 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.04 
 
 		 526 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.23 
 
 		 463 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  25.24 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.24 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.24 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 466 aa  96.7  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 516 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0856329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 		 508 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 466 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.24 
 
 		 457 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.24 
 
 		 457 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.24 
 
 		 457 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  27.37 
 
 		 469 aa  96.3  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.24 
 
 		 457 aa  96.3  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  26.65 
 
 		 462 aa  96.3  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.72 
 
 		 471 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  36.53 
 
 		 492 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.13 
 
 		 524 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.74 
 
 		 456 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 457 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0983  major facilitator superfamily MFS_1  35.83 
 
 		 484 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  24.09 
 
 		 457 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.46 
 
 		 471 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  24.09 
 
 		 457 aa  94  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 457 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  24.09 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 457 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 457 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 457 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  24.09 
 
 		 457 aa  93.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.47 
 
 		 477 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.28 
 
 		 486 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.28 
 
 		 486 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.28 
 
 		 486 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.28 
 
 		 486 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 478 aa  93.2  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.28 
 
 		 486 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.28 
 
 		 486 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 515 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0858  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 480 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950152  normal  0.413443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.53 
 
 		 458 aa  92.8  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 455 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 455 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.74 
 
 		 513 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.68 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 455 aa  91.3  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 462 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1157  major facilitator family transporter  32.74 
 
 		 459 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.93 
 
 		 513 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.46 
 
 		 505 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 		 520 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 		 520 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.98 
 
 		 520 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  29.67 
 
 		 526 aa  90.1  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.71 
 
 		 520 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 504 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 465 aa  90.5  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>