More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3626 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 414 aa  807    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  58.88 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  59.14 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  52.21 
 
 		 411 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 		 395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 410 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0223  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.339791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.01 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.01 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.01 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.32 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  24.32 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  24.32 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  26.04 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 384 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  23.71 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.56 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  21.82 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  24.2 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0910  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  26.15 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.39 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  29.41 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 432 aa  67  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 401 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  30.06 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0928  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.554921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  28.4 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.01 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2132  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.6 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3958  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2696  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.236302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2072  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  25.69 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.29 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.52 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  28.48 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.69 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  28.44 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.65 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  26.28 
 
 		 526 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2838  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0298937  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2164  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570545  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  25.49 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2778  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>