More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3467 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3467  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
751 aa  1492    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.124475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0235  CheA signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 
759 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27811 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  46.78 
 
 
747 aa  599  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2708  CheA signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 
735 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.972076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0298  CheA signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 
763 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265941  normal  0.326442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  45.72 
 
 
751 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1794  CheA signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
686 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3206  CheA signal transduction histidine kinases  42.68 
 
 
711 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136095  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2436  chemotaxis histidine protein kinase, CheA1  43.43 
 
 
686 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.916157  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1100  CheA signal transduction histidine kinases  43.15 
 
 
686 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.748454  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4077  Chemotaxis protein histidine kinase  44.78 
 
 
662 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2841  CheA signal transduction histidine kinases  40.85 
 
 
748 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.922689  normal  0.260415 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  38.48 
 
 
720 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
694 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  37.02 
 
 
669 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 
682 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  37.25 
 
 
715 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  35.86 
 
 
703 aa  423  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
684 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1446  CheA signal transduction histidine kinase  55.32 
 
 
760 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  37.02 
 
 
681 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
684 aa  412  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
695 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
707 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1852  CheA signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
664 aa  403  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.758409  normal  0.445859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0330  CheA signal transduction histidine kinase  52.96 
 
 
758 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.362553  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
688 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  37 
 
 
655 aa  402  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  36.83 
 
 
783 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0091  CheA signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
702 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
724 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  34.58 
 
 
717 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  35.33 
 
 
704 aa  392  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  40.95 
 
 
806 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
728 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
724 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
686 aa  379  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1533  CheA signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
750 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2106  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
709 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0901  CheA signal transduction histidine kinases  34.46 
 
 
720 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1540  CheA signal transduction histidine kinases  35.01 
 
 
708 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1290  chemotaxis protein CheA  35.28 
 
 
701 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3296  CheW-like protein  33.02 
 
 
733 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0264  CheA signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
654 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.555417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
677 aa  365  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  48.95 
 
 
684 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3798  CheA signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
732 aa  365  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  42.34 
 
 
662 aa  364  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1142  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.11 
 
 
741 aa  363  9e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0913  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  34.65 
 
 
700 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  46.95 
 
 
669 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  46.95 
 
 
669 aa  362  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  41.9 
 
 
674 aa  360  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  44.98 
 
 
654 aa  360  6e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  46.95 
 
 
669 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  44.98 
 
 
654 aa  360  7e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 
654 aa  360  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  46.95 
 
 
669 aa  360  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  44.98 
 
 
654 aa  360  7e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  46.95 
 
 
669 aa  360  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  44.98 
 
 
652 aa  360  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  44.98 
 
 
654 aa  360  8e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  44.98 
 
 
652 aa  360  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  44.74 
 
 
654 aa  359  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  44.98 
 
 
654 aa  359  9e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  47.66 
 
 
672 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 
732 aa  358  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1416  CheA signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
686 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2651  CheA signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
682 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22610  CheA signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
699 aa  353  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3563  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
679 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0974951 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
724 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  46.6 
 
 
729 aa  352  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  46.49 
 
 
724 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
724 aa  351  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4316  Chemotaxis protein histidine kinase  36.15 
 
 
685 aa  350  5e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  39.88 
 
 
717 aa  350  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  47.16 
 
 
691 aa  350  7e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2940  CheA signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
708 aa  349  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 
743 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0871  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
694 aa  347  6e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
761 aa  347  6e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  45.41 
 
 
744 aa  347  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  45.32 
 
 
697 aa  346  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2619  CheA signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
698 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
749 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1738  CheA signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
709 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.791602  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  46.45 
 
 
719 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0974  CheA signal transduction histidine kinases  31.54 
 
 
691 aa  344  4e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  46.61 
 
 
671 aa  343  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 
750 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  44.91 
 
 
756 aa  343  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  44.91 
 
 
756 aa  343  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  45.97 
 
 
767 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  45.97 
 
 
767 aa  343  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  44.17 
 
 
727 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  45.97 
 
 
767 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  45.97 
 
 
767 aa  343  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  44.94 
 
 
772 aa  342  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4676  CheA signal transduction histidine kinases  32.83 
 
 
686 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>