More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3110 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3110  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 469 aa  907    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3373  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  47.4 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0970246  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1140  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2300  major facilitator transporter  47.11 
 
 		 455 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2436  major facilitator transporter  47.11 
 
 		 455 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3792  major facilitator transporter  49.16 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.57884 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5717  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1779  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2391  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1267  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  48.71 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2396  major facilitator transporter  48.31 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124422 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3013  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.47 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1113  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.47 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3036  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.47 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.47 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3304  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0899  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 455 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142459 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1107  transport protein YebQ  48.1 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.47 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.028238  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3520  major facilitator transporter  45.71 
 
 		 475 aa  352  8e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 455 aa  351  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0903  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.56 
 
 		 457 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2121  major facilitator transporter  45.95 
 
 		 480 aa  350  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000118824  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3984  putative MFS superfamily transport protein  43.81 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2143  major facilitator transporter  47.17 
 
 		 480 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172092  hitchhiker  0.000390012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3326  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 		 459 aa  341  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4770  MFS family transporter  45.37 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2398  major facilitator transporter  44.99 
 
 		 457 aa  340  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2166  major facilitator transporter  48.32 
 
 		 498 aa  338  9e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  44.02 
 
 		 464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  44.34 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1359  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000544866  normal  0.0171999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3605  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 472 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4444  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3923  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 453 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3816  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 491 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524764  normal  0.933625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3665  major facilitator transporter  44.3 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2203  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  46.84 
 
 		 455 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190205  normal  0.434224 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 457 aa  329  8e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0974065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2057  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 457 aa  329  8e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276099  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1804  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 457 aa  329  8e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.673075  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2096  transporter, major facilitator family  44.44 
 
 		 457 aa  329  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000334622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1919  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 457 aa  329  8e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01799  predicted transporter  44.2 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.702332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01787  hypothetical protein  44.2 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.868049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2560  transporter, major facilitator family  44.44 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3300  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 497 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.471538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5967  major facilitator superfamily MFS_1  47.23 
 
 		 455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4320  major facilitator transporter  44.65 
 
 		 446 aa  326  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3129  major facilitator transporter  48.22 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0660329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4542  major facilitator superfamily transporter  44.6 
 
 		 490 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.061139  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3450  major facilitator superfamily MFS_1  47.74 
 
 		 459 aa  323  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1309  major facilitator superfamily MFS_1  46.26 
 
 		 455 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0923  major facilitator transporter  45.95 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.298675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2164  major facilitator transporter  46.38 
 
 		 476 aa  316  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4661  major facilitator transporter  46.73 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2896  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2000  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 		 468 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0919237  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1703  major facilitator superfamily transporter  40.97 
 
 		 468 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1280  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.71 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.086672  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1868  major facilitator superfamily transporter  43.57 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1017  transporter, putative  42.42 
 
 		 459 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.525895  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0958  putative transporter  42.42 
 
 		 442 aa  294  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04823  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  38.85 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05653  putative efflux PUMP antibiotic resistance transmembrane protein  38.85 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3366  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.209391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2995  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 461 aa  256  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.35009  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6917  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.35 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6200  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 		 481 aa  239  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 		 475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 474 aa  180  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.57 
 
 		 500 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.6 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2797  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.34 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.49 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 		 465 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1448  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.307254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1253  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.58 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.35553  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.34 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.08 
 
 		 462 aa  149  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 		 490 aa  143  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 		 460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.93 
 
 		 478 aa  140  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.75 
 
 		 472 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2018  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 470 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.132894  normal  0.221314 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.99 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.36 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.37 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.12 
 
 		 478 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>