213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3471 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3471  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 303 aa  606  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5387  alpha/beta hydrolase  36.84 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1827  hydrolase  34.71 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5789  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.0718304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3473  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.338124  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2686  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.698481 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  28.69 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5749  Alpha/beta hydrolase  37.32 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2171  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5547  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093894 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2426  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 		 408 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278939 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1810  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424856  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2422  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00445003  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17930  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.21 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.659857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  26.32 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000127113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  39.29 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  24.44 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  24.81 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3109  Ndr family protein  29.37 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  39.76 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 332 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  38.64 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 297 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  40.38 
 
 		 300 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1006  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4023  alpha/beta hydrolase fold protein  33.5 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  30.33 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  33.62 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  38.28 
 
 		 324 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  35.65 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  41.86 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  26.72 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  29.37 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  33.33 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.23 
 
 		 370 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  26.72 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2694  alpha/beta fold family hydrolase  23.3 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00231525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0513  putative hydrolase  28.18 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36689  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0795  alpha/beta hydrolase fold protein  35.63 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  0.361628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  38.61 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  25.93 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 261 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  29.38 
 
 		 260 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2759  alpha/beta hydrolase fold  39.24 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0191279  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  35.58 
 
 		 262 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.45 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  31.34 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.45 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 288 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.78 
 
 		 367 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  37.25 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 341 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  33.33 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  35.4 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.61 
 
 		 369 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.04 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2642  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  34.23 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0477  twin-arginine translocation pathway signal  41.3 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  33.33 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.04 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.04 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.78 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>