More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0978 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  63.29 
 
 		 606 aa  822    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  62.96 
 
 		 622 aa  816    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  91.54 
 
 		 650 aa  1144    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 647 aa  1316    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  65.69 
 
 		 602 aa  855    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  51.92 
 
 		 608 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  45.12 
 
 		 628 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  41.02 
 
 		 607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  41.67 
 
 		 608 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  41.24 
 
 		 607 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  40.34 
 
 		 605 aa  458  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  57.29 
 
 		 589 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  40.52 
 
 		 601 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  38.33 
 
 		 632 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  38.48 
 
 		 623 aa  425  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  38.69 
 
 		 632 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  38.69 
 
 		 633 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  38.54 
 
 		 632 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  38.66 
 
 		 641 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  38.33 
 
 		 633 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  38.32 
 
 		 633 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  38.66 
 
 		 635 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  36.1 
 
 		 647 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  38.44 
 
 		 633 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  38.44 
 
 		 648 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 630 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  37.28 
 
 		 655 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  38.43 
 
 		 629 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  37 
 
 		 645 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  38.18 
 
 		 625 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  38.7 
 
 		 611 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  36.84 
 
 		 615 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 644 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  36.84 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  37.08 
 
 		 602 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  36.73 
 
 		 635 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  37.79 
 
 		 616 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  37.23 
 
 		 613 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  37.85 
 
 		 636 aa  395  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  36.25 
 
 		 652 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  37.17 
 
 		 611 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  38.02 
 
 		 622 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  36.24 
 
 		 612 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  37.63 
 
 		 619 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  36.21 
 
 		 670 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  37.44 
 
 		 604 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  35.61 
 
 		 661 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  37.33 
 
 		 640 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  36.52 
 
 		 647 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  38.15 
 
 		 639 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  38.11 
 
 		 632 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  35.95 
 
 		 641 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  37.5 
 
 		 644 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  38.72 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  38.13 
 
 		 606 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  35.68 
 
 		 691 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  37.95 
 
 		 648 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  34.94 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 		 665 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  36.4 
 
 		 687 aa  382  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  36.46 
 
 		 628 aa  379  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  37.69 
 
 		 661 aa  378  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  36.78 
 
 		 705 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  37.33 
 
 		 612 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  35.9 
 
 		 617 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  36.29 
 
 		 598 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  35.91 
 
 		 594 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  37.19 
 
 		 671 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  34.56 
 
 		 611 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  36.45 
 
 		 635 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  34.52 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  33.08 
 
 		 644 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  34.24 
 
 		 659 aa  370  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  33.8 
 
 		 647 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 		 600 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  36.49 
 
 		 643 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  36.32 
 
 		 600 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  34.3 
 
 		 656 aa  372  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 645 aa  368  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 647 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  33.24 
 
 		 695 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  32.98 
 
 		 647 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  36.11 
 
 		 603 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  36.73 
 
 		 605 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 647 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  36.39 
 
 		 628 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 647 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 647 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  32.29 
 
 		 669 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 		 623 aa  364  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 626 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  34.28 
 
 		 668 aa  364  3e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  35.34 
 
 		 623 aa  364  3e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  32.97 
 
 		 626 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  37.35 
 
 		 603 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  32.6 
 
 		 649 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  30.93 
 
 		 644 aa  362  8e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  33.33 
 
 		 647 aa  362  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  35.14 
 
 		 624 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  33.84 
 
 		 647 aa  361  2e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>