More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3301 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3301  ROK family protein  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_3152  ROK family protein  80 
 
 		 291 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0234  ROK family protein  59.38 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1578  ROK family protein  55.44 
 
 		 292 aa  349  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2639  fructokinase  57.24 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.293281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0164  ROK family protein  56.4 
 
 		 301 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0111  ROK family protein  58.04 
 
 		 299 aa  309  4e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.891557  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3416  ROK family protein  57.24 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0682932 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1584  fructokinase  47.4 
 
 		 291 aa  272  6e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  47.2 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1689  fructokinase  45.17 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1709  fructokinase  44.48 
 
 		 297 aa  258  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00007225  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1708  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / fructokinase  47.59 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0154  ROK family protein  42.16 
 
 		 287 aa  253  3e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1151  ROK family protein  46.55 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.602337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1885  fructokinase  44.37 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00853813  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0014  transcriptional regulator and fructokinase  39.73 
 
 		 294 aa  218  7.999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000579085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3962  fructokinase  38.75 
 
 		 296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.177192 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32817  predicted protein  38.57 
 
 		 347 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0965  ROK family protein  37.76 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5275  ROK family protein  37.76 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244347 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  34.27 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  34.27 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  28.84 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31.69 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48173  predicted protein  30.4 
 
 		 764 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.738632  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  31.25 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  27.88 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.07 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_16050  glucokinase  26.99 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  28.91 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30.16 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
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NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.79 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.18 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.61 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.05 
 
 		 414 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  27.53 
 
 		 389 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  28.14 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  27.36 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  29.87 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  28.57 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  27.02 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.19 
 
 		 410 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  28.53 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  27.27 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  27.09 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_4339  glucokinase  27.22 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  27.89 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  27.01 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0885  ROK  25.57 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  29.15 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  28.33 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  30 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  28.28 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  28.28 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  27.13 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  25.85 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  27.36 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  27.27 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  28.67 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
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NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  31.74 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.86 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  34.9 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.62 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  27.67 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.18 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  30.61 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  26.6 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  30.52 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  33.17 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  26.71 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  27.61 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  31.74 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.28 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  28.57 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  27.55 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  28.57 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  29.38 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  27.74 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  29.97 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  30.23 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  28.04 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  33.66 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  25.81 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4084  glucokinase  28.84 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  27.4 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252732 
 
 
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NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.8 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  27.84 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  26.37 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
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NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  25.27 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  26.1 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008530  LGAS_0197  transcriptional regulator/sugar kinase  25.08 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000610639  normal  0.262374 
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.56 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  26.79 
 
 		 389 aa  72.8  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_24860  glucokinase  35.29 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
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NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  31.03 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  28.3 
 
 		 420 aa  72.4  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  30.04 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
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NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  28.51 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
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NC_008701  Pisl_0979  ROK family protein  27.52 
 
 		 315 aa  72  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.607757 
 
 
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