More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2113 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
205 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  80.98 
 
 
206 aa  333  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  62.19 
 
 
207 aa  256  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  61.69 
 
 
207 aa  255  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  61.69 
 
 
207 aa  255  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  61.69 
 
 
207 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  61.19 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  61.19 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  60.7 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  61.19 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  61.19 
 
 
207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  60.7 
 
 
207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  60.7 
 
 
207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0633  protein of unknown function UPF0126  54.46 
 
 
226 aa  211  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0387  hypothetical protein  56.25 
 
 
204 aa  204  9e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  36.15 
 
 
223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  38.12 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  37.31 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  37.69 
 
 
209 aa  111  9e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  35.75 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2816  protein of unknown function UPF0126  36.98 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.830347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  37.88 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  35.05 
 
 
209 aa  106  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4741  hypothetical protein  39.41 
 
 
219 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  36.27 
 
 
214 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  32.31 
 
 
209 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  35.27 
 
 
210 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1024  protein of unknown function UPF0126  34.72 
 
 
203 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000120262  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  35.35 
 
 
208 aa  102  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  37.44 
 
 
211 aa  102  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  32.52 
 
 
204 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1772  protein of unknown function UPF0126  36.27 
 
 
209 aa  102  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000240599  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  37.86 
 
 
220 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  38.19 
 
 
202 aa  101  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  36.5 
 
 
208 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2523  protein of unknown function UPF0126  36.18 
 
 
209 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.759847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  33.33 
 
 
203 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0998  hypothetical protein  36.67 
 
 
213 aa  99.8  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428082 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  33.67 
 
 
206 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  36.99 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  35.29 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  34.69 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  38.19 
 
 
202 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  38.19 
 
 
202 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  38.19 
 
 
202 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  38.19 
 
 
202 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  38.19 
 
 
202 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  36.1 
 
 
208 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  36.1 
 
 
208 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  36.59 
 
 
208 aa  99  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0879  protein of unknown function UPF0126  35.75 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  35.68 
 
 
223 aa  98.2  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  34.01 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  34.01 
 
 
221 aa  98.2  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  36.23 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  31.96 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.0000135142 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1555  protein of unknown function UPF0126  40.13 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.283277  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  31.96 
 
 
203 aa  97.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2854  hypothetical protein  36.27 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.209726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  35.15 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0263  hypothetical protein  34.18 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000221431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  34.2 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  34.2 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  37.69 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1850  hypothetical protein  38 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.129061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  34.2 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0697  hypothetical protein  36.27 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  34.2 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0182  hypothetical protein  33.55 
 
 
205 aa  97.1  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  33.81 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1847  hypothetical protein  38.05 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  32.81 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  33.16 
 
 
223 aa  95.9  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  36.87 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  33.67 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  31.37 
 
 
217 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  32.02 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  39.31 
 
 
204 aa  95.9  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  32.99 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  35.44 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  35.44 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  35.44 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  35.44 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  32.35 
 
 
213 aa  95.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  33.17 
 
 
199 aa  95.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  33 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  28.71 
 
 
210 aa  95.1  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  35.68 
 
 
209 aa  95.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1303  hypothetical protein  36.73 
 
 
209 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.306176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  38.89 
 
 
208 aa  94  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0012  hypothetical protein  39.44 
 
 
216 aa  94  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  39.22 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  39.22 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  39.22 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  39.22 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  39.22 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>