More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2371 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2371  type II secretion system protein E  100 
 
 
348 aa  717    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0204  type II secretion system protein E  61.78 
 
 
357 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3985  comG operon protein 1  56.01 
 
 
347 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0411911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4264  comG operon protein 1  56.01 
 
 
348 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4145  comG operon protein 1  56.01 
 
 
347 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.501429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4466  ComG operon protein 1  56.01 
 
 
347 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000357704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4374  comG operon protein 1  55.13 
 
 
348 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3995  comG operon protein 1  54.84 
 
 
347 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4097  type II secretion system protein E  54.25 
 
 
347 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00448578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4355  comG operon protein 1  54.84 
 
 
347 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4321  comG operon protein 1  54.55 
 
 
347 aa  363  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  47.35 
 
 
571 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  47.21 
 
 
417 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  44.89 
 
 
558 aa  242  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.32 
 
 
553 aa  242  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2020  type II secretion system protein E  46.24 
 
 
386 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.453944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  43.53 
 
 
561 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  39.54 
 
 
885 aa  235  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  44 
 
 
505 aa  235  7e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  43.17 
 
 
561 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  45.39 
 
 
891 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  43.73 
 
 
558 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  45.04 
 
 
888 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2928  type II secretion system protein E  56.91 
 
 
194 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.52319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  44.24 
 
 
561 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  41.45 
 
 
477 aa  233  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0910  type II secretion system protein E  44.85 
 
 
561 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.661185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  45.49 
 
 
573 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  43.17 
 
 
501 aa  232  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  41.09 
 
 
787 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  44.07 
 
 
491 aa  232  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  44.09 
 
 
562 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  43.88 
 
 
564 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  44.77 
 
 
571 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  43.07 
 
 
507 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  42.71 
 
 
568 aa  230  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  42.24 
 
 
560 aa  229  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  39.6 
 
 
595 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  44.13 
 
 
563 aa  229  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  41.22 
 
 
482 aa  229  8e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  43.55 
 
 
573 aa  228  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  43.37 
 
 
558 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  39.6 
 
 
595 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  43.43 
 
 
503 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.71 
 
 
557 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.01 
 
 
570 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
591 aa  226  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  43.43 
 
 
500 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.06 
 
 
561 aa  225  7e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  42.65 
 
 
521 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  42.65 
 
 
521 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  43.42 
 
 
498 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  42.65 
 
 
521 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  42.65 
 
 
521 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  42.09 
 
 
585 aa  225  9e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  42.65 
 
 
521 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  44.74 
 
 
568 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  40.51 
 
 
595 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  42.65 
 
 
521 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  42.65 
 
 
521 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  42.7 
 
 
580 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  42.34 
 
 
523 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  44 
 
 
585 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  41.61 
 
 
514 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  42.28 
 
 
521 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  36.04 
 
 
597 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  44.57 
 
 
484 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  42.29 
 
 
498 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  42.65 
 
 
514 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  43.07 
 
 
497 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  42.65 
 
 
521 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  42.03 
 
 
523 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  42.28 
 
 
520 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  42.18 
 
 
561 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  43.38 
 
 
522 aa  223  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1430  pilin/fimbriae biogenesis protein  40.78 
 
 
471 aa  223  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  42.86 
 
 
511 aa  223  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0643  type II secretion system protein E  40.53 
 
 
371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000183544  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.01 
 
 
554 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  42.65 
 
 
553 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  41.96 
 
 
520 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  40.65 
 
 
583 aa  222  6e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  41.01 
 
 
598 aa  222  8e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.84 
 
 
553 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  43.07 
 
 
501 aa  222  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  41.05 
 
 
573 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  43.13 
 
 
871 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  44 
 
 
567 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
577 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  40.56 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  42.47 
 
 
557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  40.56 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  42.28 
 
 
523 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  42.47 
 
 
557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  41.46 
 
 
583 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  40.56 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  40.43 
 
 
806 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2780  type II secretion system protein E  43.01 
 
 
548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1464  general secretory pathway protein E  40.57 
 
 
519 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1644  general secretory pathway protein E  40.57 
 
 
519 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>