More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1203 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  50.23 
 
 		 645 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  63.99 
 
 		 644 aa  834    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  64.3 
 
 		 647 aa  834    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  64.1 
 
 		 647 aa  835    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  64.77 
 
 		 626 aa  838    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  64.14 
 
 		 647 aa  831    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  64.3 
 
 		 647 aa  832    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 619 aa  1274    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  63.69 
 
 		 647 aa  832    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  64.77 
 
 		 626 aa  838    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  64.25 
 
 		 649 aa  838    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  72.91 
 
 		 630 aa  900    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  64.61 
 
 		 647 aa  833    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  48.74 
 
 		 669 aa  649    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  64.61 
 
 		 647 aa  838    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  46.86 
 
 		 659 aa  591  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  45.9 
 
 		 668 aa  590  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  47.01 
 
 		 647 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  46.91 
 
 		 656 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  44.04 
 
 		 648 aa  552  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  41.41 
 
 		 639 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  40.5 
 
 		 630 aa  434  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  39.17 
 
 		 585 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  39.29 
 
 		 603 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  40.06 
 
 		 640 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  37.28 
 
 		 680 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  37.16 
 
 		 665 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  38.76 
 
 		 644 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  39.13 
 
 		 620 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  36.26 
 
 		 674 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  35.96 
 
 		 674 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  38.06 
 
 		 614 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  38.75 
 
 		 612 aa  405  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.64 
 
 		 612 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  38.3 
 
 		 622 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  36.25 
 
 		 586 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  37.4 
 
 		 631 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  36.41 
 
 		 566 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.59 
 
 		 628 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  34.68 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  36.07 
 
 		 599 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  36.69 
 
 		 605 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  34.69 
 
 		 647 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  36.57 
 
 		 566 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.15 
 
 		 606 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  34.17 
 
 		 632 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  36.29 
 
 		 622 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 		 647 aa  364  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 		 650 aa  363  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  36.6 
 
 		 605 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  36.49 
 
 		 605 aa  363  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  37.58 
 
 		 588 aa  361  2e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  35.68 
 
 		 566 aa  359  8e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  36.41 
 
 		 559 aa  357  3.9999999999999996e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  34.73 
 
 		 602 aa  354  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  35.5 
 
 		 584 aa  354  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  36.51 
 
 		 612 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  34.89 
 
 		 608 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.28 
 
 		 626 aa  348  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  35.11 
 
 		 603 aa  347  3e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  33.07 
 
 		 589 aa  347  3e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  35.49 
 
 		 632 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 636 aa  346  7e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  36.33 
 
 		 620 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  35.29 
 
 		 616 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  35.11 
 
 		 560 aa  342  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  33.86 
 
 		 647 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  34.08 
 
 		 608 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  33.96 
 
 		 635 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  35.05 
 
 		 608 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  33.23 
 
 		 629 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  34.17 
 
 		 655 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 		 652 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  35.61 
 
 		 621 aa  337  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  34.85 
 
 		 589 aa  337  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  34.44 
 
 		 600 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.87 
 
 		 624 aa  337  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  34.7 
 
 		 607 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  33.54 
 
 		 629 aa  336  9e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  34.5 
 
 		 600 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  34.7 
 
 		 607 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 		 601 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  33.02 
 
 		 626 aa  331  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  35.55 
 
 		 641 aa  332  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  34.44 
 
 		 661 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  34.9 
 
 		 687 aa  329  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  35.05 
 
 		 628 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  34.98 
 
 		 648 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  33.53 
 
 		 671 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  34.13 
 
 		 605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  34.47 
 
 		 621 aa  328  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  33.02 
 
 		 623 aa  325  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  33.02 
 
 		 623 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  33.65 
 
 		 644 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  34.07 
 
 		 615 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  32.55 
 
 		 622 aa  324  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 630 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 		 625 aa  324  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  33.44 
 
 		 574 aa  323  5e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  33.12 
 
 		 626 aa  323  5e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>