More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2677 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2677  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  567  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  47.55 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  47.2 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  47.89 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  47.89 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  47.89 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  47.54 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  47.55 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  47.93 
 
 		 402 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.54 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  45.96 
 
 		 308 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  49.48 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  49.48 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  49.48 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  49.48 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  49.13 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  47.18 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  49.13 
 
 		 356 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  49.13 
 
 		 356 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0868  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.13 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  43.31 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1002  hypothetical protein  47.44 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.696154  normal  0.774388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  38.16 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.32 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.84 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  32.62 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.57 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  26.28 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.64 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  34.63 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  24.48 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.21 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1449  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  30.27 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  31.6 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  23.95 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2881  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.59 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0270  hypothetical protein  35.92 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.486375  normal  0.729912 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  25.95 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  25.26 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.579422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0790  hypothetical protein  30.41 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356616  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2506  hypothetical protein  30.3 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2384  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  27.3 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  27.45 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1984  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.825306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  27.45 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  30.39 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  29.58 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  27.06 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  30.04 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  32.86 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  30.45 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.72 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.67 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  31.71 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  31.77 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.66 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  30.21 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  31.23 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  30.21 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  30.21 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2187  hypothetical protein  29.21 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0754091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.22 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  24.56 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  30.41 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  25.49 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.85 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1364  hypothetical protein  26.04 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  30.14 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  28.72 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.29 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  26.38 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  29.6 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  28.09 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  27.78 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  24.15 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  31.05 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  29.1 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0562  hypothetical protein  28.28 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.368396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  21.29 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  28.02 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  29.55 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.23 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  25.08 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2236  hypothetical protein  29.39 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560501  normal  0.770615 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.67 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  25.88 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>