More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2069 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  77.11 
 
 		 206 aa  324  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  64.18 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  61.19 
 
 		 212 aa  254  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  60.7 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  56.72 
 
 		 210 aa  238  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  53.77 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  39.11 
 
 		 256 aa  158  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.47 
 
 		 236 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  39.11 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  38.17 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  37.62 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.3 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.89 
 
 		 247 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  39.25 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.79 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.22 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.76 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  31.35 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  33.74 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  33.13 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.13 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.13 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  33.13 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  33.13 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  33.13 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  33.13 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  33.13 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.79 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  26.54 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  28.11 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  29.26 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  25.93 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  41.05 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  34.15 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  27.23 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  24.73 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25.27 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  26.2 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  28.64 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  26.76 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  26.76 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  26.76 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  26.76 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  28.27 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  26.48 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.73 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  38.14 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.13 
 
 		 618 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.63 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.93 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  27.41 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  26.29 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  39.45 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  28.65 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  25.96 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  26.44 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.28 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  37.29 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.61 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  27.81 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.35 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.35 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000437323  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  28.71 
 
 		 272 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.92 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.04 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.37 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.02 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0508  HAD family hydrolase  57.78 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.13325  normal  0.112078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  25 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  24.73 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.01 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  38.89 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  24.74 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>