More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0816 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 248 aa  503  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  86.69 
 
 		 248 aa  450  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  79.03 
 
 		 248 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  72.58 
 
 		 248 aa  377  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  70.73 
 
 		 250 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  56.1 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  50 
 
 		 266 aa  259  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 363 aa  244  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  48.12 
 
 		 296 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  48.18 
 
 		 257 aa  235  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  46.94 
 
 		 268 aa  235  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  47.37 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  47.15 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  47.15 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  47.08 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  43.32 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  45.53 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  42.28 
 
 		 266 aa  221  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  46.28 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1008  ABC transporter related  44.35 
 
 		 397 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00677316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  46.03 
 
 		 263 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  43.32 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  43.44 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  43.5 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  42.21 
 
 		 421 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 359 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3442  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0228809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  46.4 
 
 		 257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  43.93 
 
 		 378 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  45.27 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40.57 
 
 		 262 aa  211  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  44.3 
 
 		 359 aa  210  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  47.2 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  43.44 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  43.44 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 397 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0479  ATPase  42.02 
 
 		 244 aa  209  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  42.39 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  46.8 
 
 		 252 aa  209  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  45.53 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  42.62 
 
 		 361 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  46.4 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  41.08 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  42.86 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  41.8 
 
 		 357 aa  208  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  43.22 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  42.8 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  41.7 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  40.91 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  44.94 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  43.97 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 		 269 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1738  ABC transporter related  41.6 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  41.95 
 
 		 269 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  42.39 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  41.8 
 
 		 362 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  40.51 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  43.04 
 
 		 363 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1695  ABC transporter related  41.6 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  42.37 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  41.7 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  44.17 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 		 294 aa  205  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  41.35 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  41.3 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  41.3 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  41.3 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  41.3 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.3 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  40.89 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  40.89 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0662  ABC transporter related  41.18 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  41.3 
 
 		 274 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.53 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  42.02 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  42.02 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.68 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  41.1 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  41.1 
 
 		 270 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 		 275 aa  201  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  41.63 
 
 		 260 aa  201  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0441  ATPase  39.92 
 
 		 244 aa  201  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  42.56 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  40.49 
 
 		 306 aa  201  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2164  ABC transporter related  43.19 
 
 		 261 aa  201  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  41.53 
 
 		 269 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  40.49 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2253  ABC transporter related  40.34 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.491715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  40.51 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>