More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0499 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  73.86 
 
 		 199 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  57.21 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  55.47 
 
 		 184 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  56.25 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  52.08 
 
 		 186 aa  141  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  53.19 
 
 		 186 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  60.53 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  62.16 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  57.39 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  46.98 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  57.01 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  50.39 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  49.53 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  51.61 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  55.14 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  47.32 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  53.7 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  50 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  46.32 
 
 		 442 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  50.96 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  53.7 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  52.78 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  51.85 
 
 		 452 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  50 
 
 		 367 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  43.66 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  46.27 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  49.11 
 
 		 394 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  42.75 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  45.53 
 
 		 313 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  47.01 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  48.15 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  50.91 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  48.21 
 
 		 423 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  49.07 
 
 		 334 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  44.53 
 
 		 387 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  50.88 
 
 		 439 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  47.33 
 
 		 610 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  38.89 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  50 
 
 		 605 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  48.11 
 
 		 411 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  53.64 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  40 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  42.95 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  49.07 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  45.52 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  48.18 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  46.55 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  49.07 
 
 		 582 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  51.82 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  46.36 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  44.07 
 
 		 430 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  50 
 
 		 440 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  47.17 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.36 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  47.27 
 
 		 318 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  50.45 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  45.54 
 
 		 450 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  45.54 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  48.62 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  49.09 
 
 		 292 aa  101  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  46.43 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  45.87 
 
 		 325 aa  101  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.14 
 
 		 375 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  50.91 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  45.05 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  45.05 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  47.75 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  50.45 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  48.15 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.13 
 
 		 376 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  50.45 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  49.09 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  46.43 
 
 		 404 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  41.96 
 
 		 456 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  45.95 
 
 		 402 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  50.45 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  42.11 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  50.45 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  48.33 
 
 		 443 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  44.44 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  50.45 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  50.45 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  42.96 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  50.45 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  50.45 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  48.15 
 
 		 363 aa  99.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  45.38 
 
 		 308 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  49.09 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  48.6 
 
 		 824 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  51.79 
 
 		 320 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  46.02 
 
 		 374 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  41.48 
 
 		 271 aa  99  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  47.71 
 
 		 323 aa  99  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  42.54 
 
 		 369 aa  99  7e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  42.96 
 
 		 372 aa  99  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  43.75 
 
 		 288 aa  99  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  43.9 
 
 		 305 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  43.9 
 
 		 305 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  50 
 
 		 299 aa  98.6  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>