More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1581 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1581  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 114 aa  233  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2653  histidine triad (HIT) protein  96.49 
 
 		 114 aa  228  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1423  HIT family protein  71.93 
 
 		 114 aa  183  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.465509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  70.18 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1225  histidine triad (HIT) protein  69.3 
 
 		 114 aa  157  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  57.02 
 
 		 367 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2705  histidine triad (HIT) protein  58.77 
 
 		 114 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.787766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0201  histidine triad (HIT) protein  56.14 
 
 		 114 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.556865  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0197  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 114 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.54784  normal  0.0954658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0190  histidine triad (HIT) protein  55.26 
 
 		 114 aa  143  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 		 114 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  53.51 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2448  histidine triad (HIT) protein  54.39 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2052  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 		 114 aa  137  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1062  HIT family hydrolase  51.33 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  52.63 
 
 		 114 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1014  histidine triad (HIT) protein  52.63 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0787  histidine triad (HIT) protein  52.63 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.614928  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0589  histidine triad (HIT) protein  54.63 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.107105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2095  histidine triad (HIT) protein  52.73 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1572  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  50.44 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000353691  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2491  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1507  histidine triad (HIT) protein  51.75 
 
 		 114 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00785087  normal  0.647378 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1334  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3216  histidine triad (HIT) protein  48.25 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000109851  hitchhiker  0.0000000041955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1575  histidine triad (HIT) protein  51.33 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  decreased coverage  0.00229819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  48.25 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  48.25 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0911  histidine triad (HIT) protein  51.79 
 
 		 113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2682  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  51.79 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2813  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  123  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0315  histidine triad (HIT) protein  49.12 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130359 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0105  histidine triad (HIT) protein  51.35 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0706  histidine triad (HIT) protein  50.88 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1931  Hit family protein  48.21 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3623  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03447  Diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  47.79 
 
 		 123 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  50 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17030  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  45.13 
 
 		 115 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.488 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  43.75 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1332  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2845  histidine triad (HIT) protein  48.65 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1047  histidine triad (HIT) protein  46.02 
 
 		 121 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.439434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2216  histidine triad (HIT) protein  49.55 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  49.11 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0843  protein kinase C inhibitor  46.02 
 
 		 118 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1055  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  49.53 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2467  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.908397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2437  histidine triad (HIT) protein  50.45 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0813  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 		 119 aa  114  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2294  histidine triad (HIT) protein  50.89 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1369  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1423  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1609  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1655  histidine triad (HIT) protein  49.17 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.387453  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1569  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0461  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0428  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0458  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221799 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0864  adenosine 5'-monophosphoramidase  43.86 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4775  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.675455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1247  histidine triad (HIT) protein  47.27 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1152  histidine triad domain-containing protein  43.86 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4293  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000283015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2076  Hit family protein  45.95 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.883813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1179  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 117 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2267  HIT (histidine triad) family protein  44.25 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  39.47 
 
 		 114 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3007  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3113  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0472  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3533  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 		 116 aa  106  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  43.12 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.429773  normal  0.93129 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  47.22 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4573  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5107  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484505  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  44.14 
 
 		 115 aa  105  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0743  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4764  histidine triad (HIT) protein  42.48 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1909  histidine triad (HIT) protein  47.37 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.388726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  47.32 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0629  histidine triad (HIT) protein  45.61 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.17683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0705  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.141106  normal  0.441968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0780  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0492692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1325  HIT family protein  42.98 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.684274  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0643  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 114 aa  103  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.586681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2265  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0115  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 118 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  46.85 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>