More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0942 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  100 
 
 
249 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  91.53 
 
 
249 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  52.8 
 
 
251 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  41.77 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  36.65 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  41.43 
 
 
254 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  40.24 
 
 
258 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  32.94 
 
 
261 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  34.82 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
276 aa  121  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  33.07 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  31.05 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  36.36 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  28.92 
 
 
243 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  29.3 
 
 
244 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  31.89 
 
 
248 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  31.5 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  31.89 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  31.23 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  25.87 
 
 
311 aa  88.6  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  27.31 
 
 
292 aa  79  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  32 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  30.43 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  31.35 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  30.52 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  28.51 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  24.51 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
318 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  30.2 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  26.02 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  27.16 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  30.08 
 
 
356 aa  58.5  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
209 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  30.66 
 
 
356 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  34.81 
 
 
360 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  33.65 
 
 
390 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
270 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  40.82 
 
 
232 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
344 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  26.83 
 
 
236 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  38.05 
 
 
456 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  31.73 
 
 
400 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  30.23 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  30.23 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  35.82 
 
 
407 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  30.23 
 
 
315 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.04 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.42 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  30.56 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.38 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  29.31 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.04 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  31.19 
 
 
653 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
341 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.03 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.29 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
341 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
337 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
365 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.09 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  36.03 
 
 
365 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  35.42 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
224 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  25.31 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
367 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  28.68 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
230 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.31 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  33.01 
 
 
185 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
209 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.87 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  25.31 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
341 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  25.31 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.31 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.64 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  30.91 
 
 
305 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  26.03 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 
230 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  30.23 
 
 
315 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  35.51 
 
 
399 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  30.71 
 
 
315 aa  52  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  33.88 
 
 
335 aa  52  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  26.9 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  28.68 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  29.51 
 
 
250 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.38 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
436 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.41 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  37.21 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>