More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6910 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.44 
 
 		 246 aa  318  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.11 
 
 		 249 aa  314  9e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.08 
 
 		 245 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.31 
 
 		 245 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 		 250 aa  208  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5100  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR family protein  45.02 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.917841  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  47.6 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  44 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  45.2 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 258 aa  191  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  43.36 
 
 		 249 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11085  conserved hypothetical protein  42.8 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.31 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  43.82 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0560932  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  41.7 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2878  putative oxidoreductase, short- chain dehydrogenase/reductase  41.85 
 
 		 271 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 		 253 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.53 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38962  normal  0.0399907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.38 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.68 
 
 		 246 aa  181  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  40.65 
 
 		 247 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.37 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.68 
 
 		 246 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  44.84 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.45 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.849975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.255418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.67 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 		 280 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  42.75 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.82 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.259784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.24 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.49 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1466  short-chain alcohol dehydrogenase  41.9 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137862  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.04 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.41 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  47.56 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  42.15 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>