56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6398 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6398  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237377  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1788  regulatory protein TetR  54.46 
 
 		 219 aa  207  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3925  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 213 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.376299  normal  0.034998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  30.11 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 201 aa  48.5  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  40 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  36.23 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  40.24 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  35.21 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  35.62 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  53.85 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  55.26 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 196 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  55.26 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  42  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 184 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 197 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 207 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 222 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 215 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  54.35 
 
 		 195 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 237 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 213 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  27.96 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 193 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>