More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6358 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2981  extracellular solute-binding protein  67.49 
 
 		 527 aa  699    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0461  extracellular solute-binding protein  62.16 
 
 		 520 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7148  extracellular solute-binding protein  69.31 
 
 		 531 aa  669    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0874465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6256  extracellular solute-binding protein  63.92 
 
 		 522 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5556  extracellular solute-binding protein  63.41 
 
 		 522 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.662967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4222  extracellular solute-binding protein  71.15 
 
 		 521 aa  743    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4214  extracellular solute-binding protein  72.35 
 
 		 481 aa  707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.329164  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6358  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 519 aa  1047    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4852  extracellular solute-binding protein  62.86 
 
 		 525 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213679  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3920  extracellular solute-binding protein  62.91 
 
 		 523 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.407855  normal  0.0244216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3291  extracellular solute-binding protein  61.92 
 
 		 519 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3398  extracellular solute-binding protein  54.84 
 
 		 528 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4213  4-phytase  62.47 
 
 		 416 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3464  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 529 aa  243  7.999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7529  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  33.67 
 
 		 541 aa  234  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3996  extracellular solute-binding protein family 5  32.99 
 
 		 536 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70207  normal  0.0901295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6369  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  59.57 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  29.17 
 
 		 551 aa  160  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0939  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 517 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  30.38 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  26.14 
 
 		 521 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 502 aa  158  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  26.14 
 
 		 521 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.14 
 
 		 521 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  26.14 
 
 		 521 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 521 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.95 
 
 		 495 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.35 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.22 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.54 
 
 		 508 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.61 
 
 		 510 aa  147  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.06 
 
 		 513 aa  147  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 528 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.17 
 
 		 492 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.17 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 538 aa  143  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.24 
 
 		 515 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 509 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 535 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  27.73 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.14 
 
 		 532 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.79 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 		 514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  28.15 
 
 		 565 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 544 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3003  extracellular solute-binding protein family 5  25.29 
 
 		 516 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  27.88 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  29.05 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0112  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1189  4-phytase  23.83 
 
 		 523 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 518 aa  134  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 520 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  25.94 
 
 		 514 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.6 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27 
 
 		 529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  24.95 
 
 		 543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  28.06 
 
 		 541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.91 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 516 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 520 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 514 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 520 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 520 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.02 
 
 		 509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.04 
 
 		 495 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.54 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.54 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.54 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 511 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.54 
 
 		 512 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 535 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 512 aa  130  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  25.1 
 
 		 546 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  29.31 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 534 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  29.54 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1380  substate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  26.82 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  29.54 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>