More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5774 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  100 
 
 
375 aa  754    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  44.06 
 
 
409 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  43.56 
 
 
408 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  41.39 
 
 
404 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  41.19 
 
 
406 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  39.67 
 
 
405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  41.27 
 
 
407 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  41.42 
 
 
395 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  39.08 
 
 
403 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  38.25 
 
 
401 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  40 
 
 
399 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  41.69 
 
 
416 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  41.05 
 
 
407 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  39.34 
 
 
399 aa  236  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  38.46 
 
 
400 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  40.05 
 
 
398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  38.46 
 
 
398 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  37.33 
 
 
408 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  38.4 
 
 
424 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  38.5 
 
 
406 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  36.24 
 
 
412 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  36.24 
 
 
412 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  38.19 
 
 
408 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  36.94 
 
 
409 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  35.97 
 
 
412 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  38.83 
 
 
407 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  38.83 
 
 
407 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.13 
 
 
394 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  39.4 
 
 
408 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  39.73 
 
 
400 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.27 
 
 
408 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  36.67 
 
 
409 aa  222  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  38.68 
 
 
402 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  38.73 
 
 
400 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  37.5 
 
 
401 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  38.38 
 
 
411 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  37.9 
 
 
409 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  38.54 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  38.12 
 
 
404 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  36.04 
 
 
421 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  36.04 
 
 
421 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  36.04 
 
 
421 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  37.8 
 
 
410 aa  219  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  39.57 
 
 
436 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.31 
 
 
405 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.22 
 
 
400 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  40.67 
 
 
406 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.95 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  35.14 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  34.72 
 
 
399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  36.43 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  37.36 
 
 
405 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  37.77 
 
 
415 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.83 
 
 
398 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  36.84 
 
 
406 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  36.84 
 
 
406 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  36.84 
 
 
406 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  36.34 
 
 
399 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  35.52 
 
 
410 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  38.23 
 
 
391 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  36.03 
 
 
405 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  36.2 
 
 
409 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  36.99 
 
 
400 aa  202  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  35.05 
 
 
423 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.99 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  36.44 
 
 
397 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  35.96 
 
 
402 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.61 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  38.25 
 
 
406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  35 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  36.78 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  34.89 
 
 
421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.57 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  35.04 
 
 
401 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.39 
 
 
419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  36.91 
 
 
430 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  34.89 
 
 
414 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  37.01 
 
 
394 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  34.96 
 
 
345 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.5 
 
 
426 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.42 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  39.31 
 
 
405 aa  193  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.78 
 
 
411 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  35.34 
 
 
397 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  39.06 
 
 
357 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.06 
 
 
411 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.78 
 
 
411 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.06 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.06 
 
 
411 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  33.33 
 
 
395 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.78 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.67 
 
 
400 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.4 
 
 
411 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.89 
 
 
400 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  35.85 
 
 
395 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  36.64 
 
 
405 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  34.15 
 
 
418 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.46 
 
 
402 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>