More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4523 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3912  ABC transporter related  52.63 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00786464  normal  0.17343 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  48.48 
 
 		 271 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.83 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  50.42 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.11 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.95 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4883  ABC transporter related  48.31 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.641028  normal  0.709013 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  48.57 
 
 		 261 aa  234  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.27 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.12 
 
 		 297 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 264 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  44.11 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  44.11 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.76 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.9 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  49.78 
 
 		 263 aa  228  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.64 
 
 		 254 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.09 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.64 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0286  ABC transporter, ATP binding protein  44.15 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.32 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  45.68 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2253  ABC transporter related  45.38 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3591  ABC transporter related  42.05 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0230  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 275 aa  224  9e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  44.86 
 
 		 278 aa  224  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0262  ABC transporter, ATP binding protein  42.8 
 
 		 281 aa  224  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.263629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.79 
 
 		 267 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.77 
 
 		 280 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  47.33 
 
 		 285 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2121  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515525  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1055  ABC transporter related  45.38 
 
 		 292 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1135  ABC transporter related  44.44 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.185737  normal  0.382668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  46.5 
 
 		 252 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  46.5 
 
 		 252 aa  222  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.26 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1043  ABC transporter related  44.44 
 
 		 270 aa  221  9e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1199  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.621607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  46.5 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.65 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.63 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.91 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2104  ABC transporter related  46.03 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0748494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  45.45 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3211  ABC transporter related  46.75 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  46.32 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.2 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  46.69 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2106  ABC transporter related  44.27 
 
 		 272 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.452782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  44.62 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  43.41 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.96 
 
 		 264 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  42.8 
 
 		 269 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  43.03 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3335  ABC transporter related  43.53 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.127136  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1831  ABC transporter related  46.32 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747209  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.68 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  43.41 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1433  ABC transporter related  44.62 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.35 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2257  ABC transporter related  45.2 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2356  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.32 
 
 		 270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659325  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  43.02 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  43.02 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  49.79 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 281 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  49.38 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  46.37 
 
 		 289 aa  214  9e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  43.28 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  43.97 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  41.91 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.26 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  45.05 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2273  ABC transporter related  45.96 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.08 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.65 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45.65 
 
 		 265 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 254 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0956  ABC transporter related  45.2 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  42.47 
 
 		 262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  42.45 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  43.6 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  45.64 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  41.95 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  48.97 
 
 		 293 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 261 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  46.31 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6068  ABC transporter ATP-binding protein  43.14 
 
 		 270 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  45.78 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>