More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3954 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2907  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  42.06 
 
 		 2683 aa  753    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3104  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.51 
 
 		 2771 aa  925    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1602  beta keto-acyl synthase  42.97 
 
 		 2531 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2105  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  44.63 
 
 		 2477 aa  690    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1453  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.97 
 
 		 2694 aa  918    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  44.27 
 
 		 2300 aa  847    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2590  Beta-ketoacyl synthase  36.06 
 
 		 1764 aa  995    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  39.89 
 
 		 1272 aa  917    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3917  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  37.54 
 
 		 1772 aa  953    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5624  polyketide synthase  47.41 
 
 		 2448 aa  805    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2931  beta-ketoacyl synthase  52.38 
 
 		 2560 aa  1280    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103099  normal  0.0735457 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3900  erythronolide synthase  32.53 
 
 		 2674 aa  767    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3202  erythronolide synthase  37.91 
 
 		 2764 aa  901    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1326  erythronolide synthase  37.9 
 
 		 2642 aa  902    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  42.69 
 
 		 2664 aa  756    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.98 
 
 		 2249 aa  675    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2666  beta-ketoacyl synthase  39.21 
 
 		 2657 aa  911    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2733  beta-ketoacyl synthase  43.28 
 
 		 2640 aa  761    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2929  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  38.77 
 
 		 2704 aa  907    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2113  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  44.53 
 
 		 2443 aa  670    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1221  beta-ketoacyl synthase  44.32 
 
 		 2620 aa  772    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3954  erythronolide synthase  100 
 
 		 2338 aa  4548    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0557912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1684  polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.02 
 
 		 2661 aa  946    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1425  beta-ketoacyl synthase  38.87 
 
 		 2693 aa  917    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1419  erythronolide synthase  39.24 
 
 		 2703 aa  921    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1423  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  39.47 
 
 		 2750 aa  923    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2665  beta-ketoacyl synthase  43.74 
 
 		 2619 aa  768    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2012  erythronolide synthase  42.96 
 
 		 2298 aa  684    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3101  beta-ketoacyl synthase  42.09 
 
 		 2266 aa  635  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  40.58 
 
 		 2414 aa  632  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  40.1 
 
 		 2189 aa  632  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  39.35 
 
 		 2260 aa  616  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  41.54 
 
 		 2553 aa  589  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  42.46 
 
 		 1845 aa  587  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  38.59 
 
 		 2503 aa  527  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  41.31 
 
 		 2314 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0926  beta-ketoacyl synthase  41 
 
 		 2628 aa  498  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1450  Erythronolide synthase  35.31 
 
 		 2327 aa  500  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  35.58 
 
 		 3243 aa  446  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 		 3115 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0465  beta-ketoacyl synthase  34.65 
 
 		 2772 aa  416  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  35.49 
 
 		 1631 aa  415  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2493  Erythronolide synthase  47.58 
 
 		 2386 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1115  erythronolide synthase  33.6 
 
 		 2542 aa  380  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  31.29 
 
 		 2754 aa  376  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  34.3 
 
 		 2888 aa  367  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6999  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  35.14 
 
 		 1929 aa  355  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355372  hitchhiker  0.00315402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0551  erythronolide synthase  34.16 
 
 		 1935 aa  353  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  36.32 
 
 		 1453 aa  348  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 		 2551 aa  347  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5614  Beta-ketoacyl synthase  33.48 
 
 		 1733 aa  347  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.0396665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  29.92 
 
 		 2176 aa  345  9e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  44.22 
 
 		 2816 aa  343  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.11 
 
 		 1372 aa  340  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0693  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.75 
 
 		 1984 aa  335  8e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  30.31 
 
 		 1656 aa  329  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  28.03 
 
 		 1087 aa  329  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  30.13 
 
 		 1587 aa  328  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 		 1874 aa  327  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  33.55 
 
 		 2376 aa  327  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  33.91 
 
 		 2374 aa  323  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  34.23 
 
 		 2614 aa  323  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  29.69 
 
 		 2462 aa  322  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  33.52 
 
 		 4478 aa  321  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  33 
 
 		 4080 aa  320  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1101  mycocerosate synthase  39.45 
 
 		 3008 aa  320  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  30.9 
 
 		 3693 aa  318  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  30.9 
 
 		 3693 aa  318  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  30.9 
 
 		 3702 aa  318  8e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3472  Beta-ketoacyl synthase  44.12 
 
 		 1480 aa  316  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296058  normal  0.129855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  29.81 
 
 		 1144 aa  311  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1449  Beta-ketoacyl synthase  41.3 
 
 		 1413 aa  311  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.62 
 
 		 3696 aa  311  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  31.55 
 
 		 3676 aa  311  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  31.93 
 
 		 3176 aa  309  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.04 
 
 		 1349 aa  305  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.76 
 
 		 3679 aa  305  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  27.7 
 
 		 1337 aa  305  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  29.05 
 
 		 1646 aa  304  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  29.04 
 
 		 1349 aa  303  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  30.11 
 
 		 7210 aa  302  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 1837 aa  301  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0866  Beta-ketoacyl synthase  31.13 
 
 		 1908 aa  301  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  27.62 
 
 		 2551 aa  300  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  28.98 
 
 		 1354 aa  299  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0927  beta-ketoacyl synthase  42.27 
 
 		 1740 aa  298  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  27.41 
 
 		 1559 aa  298  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  32.05 
 
 		 4151 aa  295  5e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  27.08 
 
 		 1559 aa  291  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  28.56 
 
 		 1909 aa  291  8e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  33.3 
 
 		 1795 aa  290  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  33.84 
 
 		 1071 aa  289  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.79 
 
 		 3092 aa  285  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  29.62 
 
 		 1939 aa  284  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.68 
 
 		 2078 aa  284  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 		 5400 aa  285  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  31.95 
 
 		 3427 aa  283  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  30.25 
 
 		 4882 aa  280  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.95 
 
 		 1101 aa  281  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  29.18 
 
 		 1653 aa  280  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>