More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2219 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2219  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 335 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205933  normal  0.043559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0833  2-dehydropantoate 2-reductase  46.46 
 
 		 297 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4304  2-dehydropantoate 2-reductase  41.22 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4496  2-dehydropantoate 2-reductase  39.3 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.650422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4708  2-dehydropantoate 2-reductase  39.93 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.392544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2354  2-dehydropantoate 2-reductase  38.82 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2307  2-dehydropantoate 2-reductase  38.82 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198557  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6083  2-dehydropantoate 2-reductase  39.34 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6133  2-dehydropantoate 2-reductase  37.16 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2289  2-dehydropantoate 2-reductase  35.76 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974409  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12593  2-dehydropantoate 2-reductase  42.56 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.510267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5159  2-dehydropantoate 2-reductase  35.92 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3136  2-dehydropantoate 2-reductase  36.15 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6450  2-dehydropantoate 2-reductase  35.86 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5585  2-dehydropantoate 2-reductase  35.53 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5949  2-dehydropantoate 2-reductase  35.53 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6421  2-dehydropantoate 2-reductase  36.15 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3174  2-dehydropantoate 2-reductase  35.47 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00987338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1469  2-dehydropantoate 2-reductase  35.14 
 
 		 296 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0942  2-dehydropantoate 2-reductase  36.15 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  37.93 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  35.86 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2165  2-dehydropantoate 2-reductase  33.67 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  34.39 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 		 325 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  31.8 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  33.22 
 
 		 301 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  33.87 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  35.31 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  32.22 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  33.85 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  35.83 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  31.85 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  30.89 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  35.51 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  35.51 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  35.51 
 
 		 329 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  35.51 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 312 aa  99.4  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2676  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  30.07 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2622  2-dehydropantoate 2-reductase  26.44 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  33.75 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4927  2-dehydropantoate 2-reductase  31.47 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332007  normal  0.934837 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  35.91 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.55 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  33.23 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 		 335 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  33.54 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.04 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  33.85 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  30.6 
 
 		 312 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  33.85 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  34.46 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  30.49 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  32.75 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  32.9 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  35.28 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 		 324 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  31.51 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  31.5 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  34.81 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  29.22 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  31.01 
 
 		 310 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  29.87 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  30.36 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  32.37 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  27.52 
 
 		 307 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  30.5 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  31.58 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10126  2-dehydropantoate 2-reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00740)  29.15 
 
 		 367 aa  86.7  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00458095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 		 314 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  28.95 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  34.02 
 
 		 325 aa  86.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  24.13 
 
 		 316 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2153  2-dehydropantoate 2-reductase  23.71 
 
 		 289 aa  85.9  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  31.89 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  31.43 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  30.35 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.92 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  28.89 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  33.85 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  32.8 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  28.04 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>