79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1768 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1768  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 592 aa  1205    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346269  normal  0.0112079 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.16 
 
 		 544 aa  193  9e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  27.03 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  29.25 
 
 		 533 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  27.9 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  27.9 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  27.95 
 
 		 510 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.43 
 
 		 546 aa  83.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  27.27 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5515  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.04 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0633809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  24.93 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  28.74 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.01 
 
 		 632 aa  70.5  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  26.03 
 
 		 732 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  26.26 
 
 		 739 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.62 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  22.19 
 
 		 504 aa  63.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  25.91 
 
 		 732 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  25.91 
 
 		 732 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  25.45 
 
 		 734 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  22.92 
 
 		 738 aa  62  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  25.45 
 
 		 754 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.61 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  25.45 
 
 		 754 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  22.8 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  25.92 
 
 		 739 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  23.28 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  22.09 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.82 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  24.05 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  23.77 
 
 		 730 aa  57.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  22.83 
 
 		 483 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  25.31 
 
 		 724 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.68 
 
 		 507 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  24.11 
 
 		 491 aa  55.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  24.31 
 
 		 714 aa  55.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  23.56 
 
 		 572 aa  54.7  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.45 
 
 		 507 aa  54.3  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  23.79 
 
 		 714 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  28.76 
 
 		 728 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  24.52 
 
 		 478 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.76 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  23.82 
 
 		 504 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2046  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.16 
 
 		 420 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.500762 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  29.2 
 
 		 714 aa  51.6  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  21.51 
 
 		 518 aa  51.2  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2594  putative phospholipase  23.92 
 
 		 684 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4970  phospholipase D/transphosphatidylase  37.84 
 
 		 684 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  30.37 
 
 		 746 aa  50.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  24.17 
 
 		 735 aa  50.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  28.1 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  28.3 
 
 		 517 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  23.03 
 
 		 803 aa  48.5  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  45.76 
 
 		 474 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.32 
 
 		 701 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6428  phospholipase D/transphosphatidylase  31.43 
 
 		 693 aa  47  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.57385 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  30.9 
 
 		 472 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.8 
 
 		 514 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67220  hypothetical protein  30.51 
 
 		 745 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.811015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.28 
 
 		 478 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.65 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  22.84 
 
 		 482 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.51 
 
 		 395 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0557  cardiolipin synthetase  31.25 
 
 		 514 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4175  phospholipase D/transphosphatidylase  38.71 
 
 		 668 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  39.13 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  24.81 
 
 		 510 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3455  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.18 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.77 
 
 		 521 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0937  phospholipase D/transphosphatidylase  21.19 
 
 		 396 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003804  cardiolipin synthetase  28.77 
 
 		 484 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0906  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.71 
 
 		 427 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.811495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03737  phospholipase protein  33.73 
 
 		 652 aa  43.9  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  30.37 
 
 		 735 aa  44.3  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3860  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.87 
 
 		 691 aa  44.3  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02693  cardiolipin synthetase  29.45 
 
 		 484 aa  43.9  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  42.22 
 
 		 482 aa  43.5  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1732  cardiolipin synthetase  28.18 
 
 		 555 aa  43.5  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000620411  normal  0.647101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1928  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.33 
 
 		 490 aa  43.5  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>