More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3776 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 361 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  82.43 
 
 		 350 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  55.78 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  57.48 
 
 		 340 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  56.12 
 
 		 340 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  56.12 
 
 		 340 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  54.98 
 
 		 350 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  56.12 
 
 		 340 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  51.66 
 
 		 314 aa  322  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  55.1 
 
 		 340 aa  318  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  51.99 
 
 		 333 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  52.03 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  50.69 
 
 		 309 aa  279  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  51.06 
 
 		 287 aa  268  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 		 290 aa  263  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 		 295 aa  258  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  47.23 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  47.84 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 		 291 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  45.86 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  35.76 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 286 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 275 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  34.41 
 
 		 284 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 284 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 291 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 291 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.31 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 291 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.35 
 
 		 285 aa  109  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  34.05 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 284 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 287 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 287 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  27.08 
 
 		 287 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  34.43 
 
 		 279 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 271 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 286 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  42.36 
 
 		 252 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 276 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 268 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 253 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.7 
 
 		 313 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 		 279 aa  96.3  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.83 
 
 		 289 aa  96.3  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  29.66 
 
 		 282 aa  96.3  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 295 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.69 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.73 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.92 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 291 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  47.66 
 
 		 282 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 		 278 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.98 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 279 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 271 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 279 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 297 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>