More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0279 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0279  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 347 aa  707    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.156801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1395  peptide chain release factor 1  67.36 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  53.6 
 
 		 356 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  53.06 
 
 		 367 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0980  peptide chain release factor 1  58.41 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000659041  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  55.02 
 
 		 359 aa  359  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  56.01 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  56 
 
 		 360 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  53.64 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  53.44 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1466  peptide chain release factor 1  65.87 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  48.46 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1420  peptide chain release factor 1  65.48 
 
 		 342 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  51.65 
 
 		 360 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  59.71 
 
 		 358 aa  352  5e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 360 aa  352  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 357 aa  352  7e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  53.12 
 
 		 360 aa  351  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 360 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 360 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  64.96 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  51.35 
 
 		 360 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  47.9 
 
 		 360 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1747  peptide chain release factor 1  49.72 
 
 		 355 aa  349  4e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75893 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  51.2 
 
 		 360 aa  348  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  51.47 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0196  peptide chain release factor 1  53.82 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.284546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  61.74 
 
 		 360 aa  346  3e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  51.03 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  52.7 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  47.34 
 
 		 360 aa  345  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  59.06 
 
 		 355 aa  345  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  51.03 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  51.03 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  51.03 
 
 		 360 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  61.72 
 
 		 356 aa  345  8e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  50.76 
 
 		 356 aa  345  8.999999999999999e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  57.5 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  50.74 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  50.74 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1806  peptide chain release factor 1  53.46 
 
 		 354 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0496443  normal  0.210435 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  50.74 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  51.6 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  50.74 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  48.57 
 
 		 357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1036  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.125967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  62.7 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0941  peptide chain release factor 1  53.25 
 
 		 350 aa  341  8e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_004310  BR1869  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 359 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  53.85 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1800  peptide chain release factor 1  49.42 
 
 		 377 aa  339  4e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  50.62 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1280  peptide chain release factor 1  48.96 
 
 		 366 aa  338  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  61.11 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000729315  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  53.14 
 
 		 351 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4206  peptide chain release factor 1  53.61 
 
 		 362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0359  peptide chain release factor 1  49.7 
 
 		 359 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3524  peptide chain release factor 1  49.71 
 
 		 359 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0041  peptide chain release factor 1  49.29 
 
 		 358 aa  335  5.999999999999999e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.334875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2623  peptide chain release factor 1  50.76 
 
 		 360 aa  335  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 360 aa  335  7e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2502  peptide chain release factor 1  47.98 
 
 		 360 aa  335  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.135893 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  51.56 
 
 		 360 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  53.21 
 
 		 355 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0750  peptide chain release factor 1  50.94 
 
 		 354 aa  335  9e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322203  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  52.88 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0980  peptide chain release factor 1  52.32 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  51.28 
 
 		 360 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  52.52 
 
 		 351 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  53 
 
 		 355 aa  334  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  52.26 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0523  peptide chain release factor 1  59.33 
 
 		 359 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0894  peptide chain release factor 1  50.91 
 
 		 351 aa  332  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188141  normal  0.50285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 351 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2999  peptide chain release factor 1  49.11 
 
 		 359 aa  332  7.000000000000001e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.381466  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 		 360 aa  332  8e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572262  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0580  peptide chain release factor 1  52.5 
 
 		 360 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.20812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  52.98 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  46.24 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2530  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 360 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3816  peptide chain release factor 1  48.53 
 
 		 359 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  50.8 
 
 		 358 aa  328  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0610  peptide chain release factor 1  48.97 
 
 		 361 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  59.14 
 
 		 361 aa  328  8e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0288  peptide chain release factor 1  49.85 
 
 		 354 aa  328  9e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 362 aa  327  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0440  peptide chain release factor 1  49.23 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0136  peptide chain release factor 1  54.29 
 
 		 359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.056338  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  50.15 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>