More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4598 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4598  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  707    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  47.38 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13163  permease  41.16 
 
 		 362 aa  262  8.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  30.42 
 
 		 341 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  29.13 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  29.83 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  29.83 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0662  protein of unknown function UPF0118  29.17 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  34.25 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  28.12 
 
 		 371 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  28.17 
 
 		 361 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  29.75 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  29.75 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  29.75 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  29.45 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  29.45 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  25 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  29.45 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  29.45 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  27.09 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  26.86 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.47 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  26.86 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  26.86 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.25 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  26.43 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  26.43 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3512  hypothetical protein  25.91 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293962  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  26.92 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  27.95 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  24.16 
 
 		 387 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.69 
 
 		 351 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  29.51 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.57 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.05 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  22.35 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2482  hypothetical protein  26.04 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  21.93 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  27.92 
 
 		 392 aa  86.3  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  26.99 
 
 		 373 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  25.19 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  24.18 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  30.69 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  30.69 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  30.69 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  30.69 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  29.5 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  29.5 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  29.5 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  30.69 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  30.69 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  30.69 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  30.69 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  30.69 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  29.5 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  29.5 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  24.5 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  29.02 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.49 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  25.9 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2977  hypothetical protein  26.89 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  26.06 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  26.06 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  26.06 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  26.06 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  25.07 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  25.9 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1911  hypothetical protein  22.85 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  22.95 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  24.1 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  23.42 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1742  putative permease PerM  26.06 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.31 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  29.95 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.34 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  26.3 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  23.1 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  23.12 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.05 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.37 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  25.97 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  21.8 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1843  hypothetical protein  21.78 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.633644  normal  0.110752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  23.12 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  25.9 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  23.56 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.76 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1757  hypothetical protein  23.33 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  21.71 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02140  putative permease  23.92 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002790  permease PerM  25.09 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  32.91 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03191  hypothetical protein  25.17 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  22.22 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  22.22 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  23.76 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1792  hypothetical protein  22.22 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  22.15 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>