More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3443 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3443  SsrA-binding protein  100 
 
 		 151 aa  303  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  67.35 
 
 		 151 aa  199  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  62.25 
 
 		 152 aa  194  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0502  SsrA-binding protein  60.14 
 
 		 153 aa  179  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.237827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  51.32 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  54.29 
 
 		 158 aa  159  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  52.11 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 153 aa  157  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1955  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 153 aa  156  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.436569  normal  0.0440292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  52.14 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  153  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3480  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 152 aa  150  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.010322  normal  0.585109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  51.06 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  48.55 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0162  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1552  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.350256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  49.28 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0710  SsrA-binding protein  51.41 
 
 		 144 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  45.26 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 157 aa  136  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3663  SsrA-binding protein  48.57 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0818654 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  46.94 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  42.36 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  46.72 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  48.55 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  44.03 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  48.55 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  43.17 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1162  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1883  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.254908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  44.6 
 
 		 158 aa  130  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  44.93 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  45.26 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  46.85 
 
 		 155 aa  130  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  42.76 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  44.53 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  45.32 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  48.15 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  48.55 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  47.83 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  48.23 
 
 		 154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  43.75 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  46.38 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  45.26 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  43.36 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  45 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  41.61 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  48.89 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  45.26 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0862  SsrA-binding protein  43.06 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  43.97 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  41.26 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 155 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  46.72 
 
 		 155 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 155 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0441  SsrA-binding protein  44.06 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.634743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  40.15 
 
 		 163 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  39.42 
 
 		 163 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  39.42 
 
 		 163 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  45.45 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  44.76 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3779  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.735326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  42.34 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>