More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2085 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 680 aa  1348    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  35.67 
 
 		 673 aa  349  9e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  31.02 
 
 		 680 aa  298  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4858  putative signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 584 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4845  putative signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 568 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415309  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  25.29 
 
 		 645 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  23.3 
 
 		 643 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  30 
 
 		 683 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  34.42 
 
 		 451 aa  101  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  26.68 
 
 		 616 aa  98.6  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 401 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  34.4 
 
 		 456 aa  96.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  28.46 
 
 		 403 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  33.49 
 
 		 451 aa  93.2  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.29 
 
 		 482 aa  93.2  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 352 aa  91.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 		 471 aa  91.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 		 775 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 348 aa  90.1  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.58 
 
 		 456 aa  90.5  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1560  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 569 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  27.38 
 
 		 653 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  22.95 
 
 		 795 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 467 aa  88.6  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 339 aa  89  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2291  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 464 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  27.05 
 
 		 645 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2641  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 468 aa  89  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  28.63 
 
 		 457 aa  88.2  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 801 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  27.09 
 
 		 373 aa  88.2  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1390  putative signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 462 aa  87.8  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  25.1 
 
 		 670 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  27.36 
 
 		 462 aa  87.4  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 402 aa  87.4  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1733  histidine kinase  26.82 
 
 		 687 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 486 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 682 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 1168 aa  86.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0821  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0106  membrane-associated sensory histidine kinase-like ATPase  33.33 
 
 		 632 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100844  normal  0.392929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  29.5 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  23.14 
 
 		 671 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  26.43 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  28.5 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  27.62 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  26.82 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  25.79 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  24.88 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0029863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  25.47 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  25.52 
 
 		 799 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 546 aa  84  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  28.57 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  24.74 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 795 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  25.34 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  26.42 
 
 		 638 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1644  histidine kinase  24.75 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  24.81 
 
 		 456 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 795 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.89 
 
 		 478 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  25.34 
 
 		 466 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 795 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.79 
 
 		 700 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6571 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 725 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  26.79 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0476  histidine kinase  25.62 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1456  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.249637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 650 aa  82.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 779 aa  82  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 526 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1133  putative signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  25.62 
 
 		 797 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  25.27 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 730 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  25.9 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  24.31 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2472  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.77 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  31.03 
 
 		 670 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  24.9 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0031  putative signal transduction histidine kinase  24.96 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0655535  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  24.89 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>