More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0031 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0031  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 589 aa  1172    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0655535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0032  TPR repeat-containing protein  47.45 
 
 		 592 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00127267  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0030  putative signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 572 aa  330  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4845  putative signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 568 aa  293  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4858  putative signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 584 aa  283  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  24.59 
 
 		 680 aa  110  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  23.47 
 
 		 673 aa  80.9  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12538  two-component sensor histidine kinase  27.58 
 
 		 606 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0257303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  20.61 
 
 		 643 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  33.33 
 
 		 738 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  20.54 
 
 		 600 aa  67  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0778  methanol utilization control sensor protein moxY, putative  21.43 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.125881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 1168 aa  66.6  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  20.71 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  36.84 
 
 		 772 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  23.27 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 		 748 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  24.35 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.23 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  22.71 
 
 		 373 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  18.33 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2102  histidine kinase  33.67 
 
 		 616 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  36.26 
 
 		 1063 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  28.95 
 
 		 381 aa  62  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  29.79 
 
 		 389 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.63 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  29.79 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.77 
 
 		 790 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2903  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  30.39 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  28.57 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4420  sensor histidine kinase  39.77 
 
 		 766 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0037892  normal  0.407304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  18.96 
 
 		 461 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 610 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  24.21 
 
 		 967 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.99 
 
 		 692 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0880  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.427062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0973  putative signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 592 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0709163  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  21.67 
 
 		 799 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  22.58 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  23.53 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  25.98 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  33.72 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0763  sensor histidine kinase  40.7 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0673199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1587  sensor protein  27.27 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.234957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  22.4 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  21.54 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  20.13 
 
 		 594 aa  57.4  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0614  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  24.07 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.797988  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 424 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  21.95 
 
 		 457 aa  57  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  23.37 
 
 		 357 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  21.59 
 
 		 380 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  27.55 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  25.88 
 
 		 380 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  22.02 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  22.02 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  23.71 
 
 		 457 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  28.12 
 
 		 1809 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 771 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  26.6 
 
 		 797 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  27.46 
 
 		 668 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  27.98 
 
 		 670 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  24.5 
 
 		 645 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  18.75 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  28.57 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  25.74 
 
 		 380 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  22.02 
 
 		 492 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0358  two-component sensor histidine kinase-like protein  21.38 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0264511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  22.02 
 
 		 492 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  22.02 
 
 		 492 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  22.02 
 
 		 492 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  22.02 
 
 		 492 aa  56.2  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  24.1 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 401 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  22.27 
 
 		 1648 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  26 
 
 		 386 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.510895  normal  0.956112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 485 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.93 
 
 		 490 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 		 402 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.41 
 
 		 468 aa  55.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  22 
 
 		 594 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 421 aa  55.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  23.91 
 
 		 364 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 420 aa  55.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  30.53 
 
 		 482 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  19.64 
 
 		 409 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>