More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4858 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4858  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 584 aa  1176    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4845  putative signal transduction histidine kinase  56.08 
 
 		 568 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0030  putative signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 572 aa  293  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0031  putative signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 589 aa  272  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0655535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0032  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00127267  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  27.15 
 
 		 680 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  26.18 
 
 		 673 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 680 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  21.97 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  27.54 
 
 		 772 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  26.4 
 
 		 797 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  24.87 
 
 		 799 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  30.81 
 
 		 1809 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  23.13 
 
 		 643 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  30.41 
 
 		 592 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  25.35 
 
 		 645 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  23.36 
 
 		 313 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  23.41 
 
 		 474 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 801 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  28.08 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0973  putative signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 		 592 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0709163  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 748 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 1168 aa  68.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  24.2 
 
 		 668 aa  67.8  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.05 
 
 		 298 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  23.5 
 
 		 461 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  23.2 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  24.39 
 
 		 738 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 795 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  26.8 
 
 		 636 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 442 aa  63.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  27.64 
 
 		 740 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  43.18 
 
 		 388 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2235  histidine kinase  29.55 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 799 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  23.98 
 
 		 795 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.2 
 
 		 411 aa  62  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.23 
 
 		 401 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  20.83 
 
 		 638 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  22.17 
 
 		 397 aa  62  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  24.1 
 
 		 1063 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  33.33 
 
 		 439 aa  62  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 546 aa  62  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  28.16 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  28.43 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  24.2 
 
 		 687 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  29.03 
 
 		 967 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  29.06 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  25.58 
 
 		 619 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  26.13 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  23.08 
 
 		 671 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1453  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 		 673 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.376354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  25.58 
 
 		 680 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  25.58 
 
 		 680 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  26.85 
 
 		 594 aa  60.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 		 795 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.62 
 
 		 485 aa  60.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 		 795 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 424 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  22.87 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  25.39 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  23.11 
 
 		 457 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  22.05 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 312 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  21.29 
 
 		 600 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 526 aa  60.1  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  25.39 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2833  histidine kinase  28.57 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.665069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  23.56 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.62 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  25.39 
 
 		 575 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  26.09 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  25.49 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  26.09 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 594 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  26.09 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.51 
 
 		 1648 aa  58.9  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  26.09 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  28.26 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  26.09 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  24.88 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  26.09 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>