More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2207 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01235  tryptophan synthase subunit beta  91.94 
 
 		 397 aa  764    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2387  tryptophan synthase, beta subunit  92.19 
 
 		 397 aa  767    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.532965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1460  tryptophan synthase subunit beta  92.19 
 
 		 397 aa  767    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00292681  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2321  tryptophan synthase subunit beta  90.75 
 
 		 396 aa  733    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3023  tryptophan synthase subunit beta  82.14 
 
 		 396 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1936  tryptophan synthase subunit beta  90.63 
 
 		 396 aa  744    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1602  tryptophan synthase subunit beta  92.95 
 
 		 397 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0886138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02762  tryptophan synthase subunit beta  81.17 
 
 		 396 aa  681    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1682  tryptophan synthase subunit beta  81.63 
 
 		 407 aa  663    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2003  tryptophan synthase subunit beta  91.39 
 
 		 396 aa  756    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2046  tryptophan synthase subunit beta  90.63 
 
 		 396 aa  744    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003084  tryptophan synthase beta chain  81.68 
 
 		 396 aa  683    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1420  tryptophan synthase subunit beta  92.95 
 
 		 397 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1871  tryptophan synthase subunit beta  92.44 
 
 		 397 aa  768    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000282354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2671  tryptophan synthase subunit beta  92.15 
 
 		 396 aa  759    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2207  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 397 aa  819    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.823385  normal  0.0123051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1660  tryptophan synthase subunit beta  81.28 
 
 		 396 aa  659    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2805  tryptophan synthase subunit beta  81.12 
 
 		 396 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2407  tryptophan synthase subunit beta  81.01 
 
 		 396 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1916  tryptophan synthase subunit beta  92.95 
 
 		 397 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000988826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1936  tryptophan synthase subunit beta  89.62 
 
 		 396 aa  743    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  81.77 
 
 		 401 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2726  tryptophan synthase subunit beta  81.28 
 
 		 396 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.93556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2366  tryptophan synthase subunit beta  92.19 
 
 		 397 aa  767    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1858  tryptophan synthase subunit beta  92.95 
 
 		 397 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1893  tryptophan synthase subunit beta  92.44 
 
 		 397 aa  769    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.964383  hitchhiker  0.00187983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2916  tryptophan synthase subunit beta  80.87 
 
 		 407 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1458  tryptophan synthase subunit beta  82.4 
 
 		 396 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1524  tryptophan synthase subunit beta  82.14 
 
 		 396 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0500753 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1370  tryptophan synthase subunit beta  92.19 
 
 		 397 aa  767    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1425  tryptophan synthase subunit beta  82.28 
 
 		 403 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1586  tryptophan synthase subunit beta  82.17 
 
 		 409 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1486  tryptophan synthase subunit beta  92.19 
 
 		 397 aa  764    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2705  tryptophan synthase subunit beta  81.28 
 
 		 396 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1516  tryptophan synthase subunit beta  82.4 
 
 		 396 aa  673    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2133  tryptophan synthase subunit beta  81.54 
 
 		 397 aa  663    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.31152  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2255  tryptophan synthase subunit beta  81.73 
 
 		 403 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0836198 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1150  tryptophan synthase subunit beta  83.21 
 
 		 396 aa  686    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2176  tryptophan synthase subunit beta  89.62 
 
 		 396 aa  746    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01245  hypothetical protein  91.94 
 
 		 397 aa  764    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0792  tryptophan synthase subunit beta  81.17 
 
 		 396 aa  677    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00347207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1853  tryptophan synthase subunit beta  92.95 
 
 		 397 aa  772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0734118 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2302  tryptophan synthase subunit beta  91.14 
 
 		 396 aa  752    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2316  tryptophan synthase subunit beta  90.63 
 
 		 396 aa  744    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1056  tryptophan synthase subunit beta  77.75 
 
 		 395 aa  611  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2833  tryptophan synthase subunit beta  73.9 
 
 		 395 aa  597  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02292  tryptophan synthase subunit beta  73.64 
 
 		 393 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3526  tryptophan synthase subunit beta  70.18 
 
 		 420 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  59.34 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  58.31 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  59.08 
 
 		 394 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  57.8 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  58.91 
 
 		 389 aa  474  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  59.79 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.13 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 443 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  58.21 
 
 		 442 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  58.87 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1741  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 394 aa  461  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 414 aa  461  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  59.74 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  59.52 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1253  bifunctional phosphoribosylanthranilate isomerase/tryptophan synthase subunit beta  58.62 
 
 		 600 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.562305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  58.55 
 
 		 391 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  55.9 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2859  tryptophan synthase, beta subunit  59.49 
 
 		 391 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1306  bifunctional phosphoribosylanthranilate isomerase/tryptophan synthase subunit beta  58.36 
 
 		 600 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209698  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  56.73 
 
 		 418 aa  455  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  58.16 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0113  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  57.11 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  59.43 
 
 		 396 aa  454  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01841  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  58.12 
 
 		 391 aa  454  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2042  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 403 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.104617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  57.68 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  58.12 
 
 		 404 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  57.25 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4373  tryptophan synthase subunit beta  59.22 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1588  tryptophan synthase subunit beta  58.81 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00363039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  56.56 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0166  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0594261  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  57.76 
 
 		 420 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  56.11 
 
 		 408 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  58.95 
 
 		 404 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  58.9 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  55.73 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01821  tryptophan synthase subunit beta  58.85 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1691  tryptophan synthase subunit beta  57.58 
 
 		 393 aa  448  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  58.64 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0755  tryptophan synthase subunit beta  56.81 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000954006  normal  0.692308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  57.03 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  57.85 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  56.36 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3589  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.738122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  56.04 
 
 		 424 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.826366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>