More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1056 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2321  tryptophan synthase subunit beta  79.33 
 
 		 396 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2302  tryptophan synthase subunit beta  77.92 
 
 		 396 aa  637    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2316  tryptophan synthase subunit beta  79.19 
 
 		 396 aa  646    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2671  tryptophan synthase subunit beta  77.92 
 
 		 396 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2003  tryptophan synthase subunit beta  78.17 
 
 		 396 aa  640    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1936  tryptophan synthase subunit beta  79.19 
 
 		 396 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2207  tryptophan synthase subunit beta  77.75 
 
 		 397 aa  634    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.823385  normal  0.0123051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2046  tryptophan synthase subunit beta  79.19 
 
 		 396 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1056  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 		 395 aa  810    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1936  tryptophan synthase subunit beta  76.9 
 
 		 396 aa  630  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2176  tryptophan synthase subunit beta  77.66 
 
 		 396 aa  632  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2255  tryptophan synthase subunit beta  76.53 
 
 		 403 aa  627  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0836198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01235  tryptophan synthase subunit beta  75.7 
 
 		 397 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003084  tryptophan synthase beta chain  75 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01245  hypothetical protein  75.7 
 
 		 397 aa  624  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2133  tryptophan synthase subunit beta  76.8 
 
 		 397 aa  624  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.31152  normal  0.733883 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2387  tryptophan synthase, beta subunit  75.7 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.532965  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1460  tryptophan synthase subunit beta  75.7 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00292681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1871  tryptophan synthase subunit beta  75.45 
 
 		 397 aa  621  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000282354 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02762  tryptophan synthase subunit beta  74.49 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1893  tryptophan synthase subunit beta  75.45 
 
 		 397 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.964383  hitchhiker  0.00187983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1425  tryptophan synthase subunit beta  75.64 
 
 		 403 aa  620  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2366  tryptophan synthase subunit beta  75.7 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  hitchhiker  0.000000273648 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0792  tryptophan synthase subunit beta  75.51 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00347207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1370  tryptophan synthase subunit beta  75.7 
 
 		 397 aa  624  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1586  tryptophan synthase subunit beta  75.84 
 
 		 409 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1420  tryptophan synthase subunit beta  75.7 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2726  tryptophan synthase subunit beta  75.97 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.93556  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1853  tryptophan synthase subunit beta  75.7 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0734118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1916  tryptophan synthase subunit beta  75.7 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000988826 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2454  tryptophan synthase subunit beta  75.64 
 
 		 401 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2805  tryptophan synthase subunit beta  75.97 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2407  tryptophan synthase subunit beta  75.97 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1858  tryptophan synthase subunit beta  75.7 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1660  tryptophan synthase subunit beta  75.97 
 
 		 396 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014764 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1602  tryptophan synthase subunit beta  75.7 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0886138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3023  tryptophan synthase subunit beta  76.23 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2916  tryptophan synthase subunit beta  75.26 
 
 		 407 aa  617  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.511307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1458  tryptophan synthase subunit beta  75.97 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1516  tryptophan synthase subunit beta  75.97 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474539 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1486  tryptophan synthase subunit beta  75.19 
 
 		 397 aa  617  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2705  tryptophan synthase subunit beta  75.71 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1682  tryptophan synthase subunit beta  75 
 
 		 407 aa  614  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1150  tryptophan synthase subunit beta  74.62 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1524  tryptophan synthase subunit beta  75.71 
 
 		 396 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0500753 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2833  tryptophan synthase subunit beta  69.67 
 
 		 395 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02292  tryptophan synthase subunit beta  68.64 
 
 		 393 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3526  tryptophan synthase subunit beta  69.51 
 
 		 420 aa  567  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  57.07 
 
 		 394 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  55.98 
 
 		 394 aa  488  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  56.74 
 
 		 394 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  60.84 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  56.49 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1120  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  57.81 
 
 		 391 aa  474  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0140  tryptophan synthase subunit beta  59.24 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  60.16 
 
 		 411 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  59.01 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12890  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 418 aa  466  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal  0.0360199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  57.66 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0222  tryptophan synthase subunit beta  58.72 
 
 		 399 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580627  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  59.11 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1683  tryptophan synthase subunit beta  57.32 
 
 		 442 aa  461  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000190343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1688  tryptophan synthase subunit beta  57.83 
 
 		 443 aa  463  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.998465  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1394  tryptophan synthase subunit beta  57.33 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000239329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1165  tryptophan synthase subunit beta  59.64 
 
 		 412 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 401 aa  458  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 411 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  59.9 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  57.59 
 
 		 396 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2965  tryptophan synthase subunit beta  59.38 
 
 		 433 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0872098  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  59.1 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11310  tryptophan synthase subunit beta  56.74 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000215917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  57.77 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  58.49 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  58.25 
 
 		 394 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  59.1 
 
 		 389 aa  457  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1216  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.268288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2237  tryptophan synthase subunit beta  58.9 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0076  tryptophan synthase subunit beta  58.53 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  57.44 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  55.81 
 
 		 409 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2521  tryptophan synthase subunit beta  58.79 
 
 		 406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 405 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1268  tryptophan synthase subunit beta  57.96 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1267  tryptophan synthase subunit beta  57.96 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3622  tryptophan synthase subunit beta  56.54 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3701  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142022 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  55.96 
 
 		 403 aa  451  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  57.7 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  58.07 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 393 aa  453  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1236  tryptophan synthase subunit beta  56.14 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.617865  normal  0.527603 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  57.89 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  59.11 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2876  tryptophan synthase subunit beta  57.44 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0961  tryptophan synthase subunit beta  55.75 
 
 		 402 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>