More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0349 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0349  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.002676  normal  0.361598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2087  transcriptional regulator  39.81 
 
 
116 aa  84.3  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  42.11 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  41.9 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  42.42 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09328  hypothetical protein  39.6 
 
 
103 aa  78.2  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  36.11 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2126  helix-turn-helix HxlR type  40.4 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.626696 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3179  transcriptional regulator family protein  34.68 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0247  HxlR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402556  normal  0.678764 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0905  transcriptional regulator family protein  34.68 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1437  transcriptional regulator family protein  36.44 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1292  transcriptional regulator, HxlR family  38.14 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109042  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  34.68 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  34.68 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  34.68 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  34.68 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3847  helix-turn-helix HxlR type  40.62 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.803353  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  36.29 
 
 
123 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3163  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 
144 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2973  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  30.89 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5668  transcriptional regulator, HxlR family  37.5 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1488  transcriptional regulator, HxlR family  41.18 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.696737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  38.38 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  36.28 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4399  hypothetical protein  37.27 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4340  hypothetical protein  37.27 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43956e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4437  hypothetical protein  36.7 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000169623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4451  hypothetical protein  37.27 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4217  hypothetical protein  37.27 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4055  transcriptional regulator  37.27 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0799  hypothetical protein  36.7 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000413922  hitchhiker  1.6907100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4065  transcriptional regulator  37.27 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.966493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4543  hypothetical protein  37.27 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719807  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6381  HxlR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06337  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  35.14 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3044  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000040463  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  38.46 
 
 
107 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3102  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
111 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
116 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  40 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  38.54 
 
 
119 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1349  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.124535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4169  HxlR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000193508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3472  transcriptional regulator  40.86 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2471  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1971  HxlR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4332  transcriptional regulator, HxlR family  40 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.101336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0653  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.174756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  33.98 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0438  transcriptional regulator, HxlR family  35.19 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0118461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  36.28 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2693  putative transcriptional regulator  37.89 
 
 
235 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  37 
 
 
118 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  33.65 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  33.65 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3069  transcriptional regulator, HxlR family  32.11 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0845928  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5264  transcriptional regulator, HxlR family  39.18 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000676248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4975  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2054  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0882  transcriptional regulator, HxlR family protein  35.71 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  29.5 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5063  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5356  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3816  HxlR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3208  hypothetical protein  45.98 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3186  MarR family transcriptional regulator  45.98 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0160  HxlR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.159433  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1405  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3461  hypothetical protein  45.98 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.692347  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0240  helix-turn-helix HxlR type  38.95 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.566878  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0168  helix-turn-helix HxlR type  38.95 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2490  transcriptional regulator  36.46 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0268874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0851  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.973222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  33.65 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2476  HxlR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  30.91 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  33.64 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  34.74 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1224  transcriptional regulator  35.78 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  43.68 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>