More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0188 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0188  PfkB domain protein  100 
 
 
302 aa  599  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.32967  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  26.99 
 
 
312 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1470  ribokinase family sugar kinase  30.58 
 
 
291 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0475498  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0159  ribokinase-like domain-containing protein  31.06 
 
 
295 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  33.22 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  33.22 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  33.22 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3309  PfkB domain protein  33.57 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  32.87 
 
 
321 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  32.86 
 
 
325 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  32.87 
 
 
321 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  32.18 
 
 
321 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  32.18 
 
 
321 aa  142  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02028  predicted kinase  32.18 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1557  PfkB domain protein  32.18 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01992  hypothetical protein  32.18 
 
 
321 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0963  PfkB family kinase  32.18 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.964628 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  32.18 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1137  kinase, PfkB family  31.83 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.231812  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3608  PfkB domain protein  31.07 
 
 
312 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06080  sugar kinase, ribokinase  29.37 
 
 
303 aa  86.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3478  PfkB domain protein  31.16 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15170  sugar kinase, ribokinase  29.49 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295543  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  30.64 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18020  sugar kinase, ribokinase  28.24 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4135  PfkB  26.67 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0867142  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2923  carbohydrate kinase, PfkB  26.69 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.123757  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  24.3 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0290  kinase, PfkB family  23.47 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  24.28 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  27.27 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  28.17 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  28.67 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08200  sugar kinase, ribokinase  29.71 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  29.95 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  26.92 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  26.36 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.21 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  21.65 
 
 
311 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  24.06 
 
 
313 aa  63.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  26.26 
 
 
305 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  20.92 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  20.92 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  20.92 
 
 
313 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  27.1 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  25.44 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  25.35 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  29.78 
 
 
303 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  25.35 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  22.71 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  26.28 
 
 
424 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  25.18 
 
 
302 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  25.54 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  25.29 
 
 
315 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  25.29 
 
 
315 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  24.82 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  23.97 
 
 
398 aa  59.7  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  26.32 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  26.07 
 
 
305 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  23.55 
 
 
319 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  26.62 
 
 
308 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  28.57 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  24.15 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  25.09 
 
 
295 aa  58.9  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  24.04 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  23.17 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  23.17 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  28.32 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  25.69 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  23.17 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  23.46 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  23.17 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  23.17 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  26.1 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  25 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3397  PfkB domain protein  26.44 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.125463 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6168  PfkB domain protein  26.3 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  hitchhiker  0.00391077 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  20.85 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  27.04 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  24.32 
 
 
403 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  27.82 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  22.67 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  25.57 
 
 
315 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  21.77 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.67 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  27.21 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.67 
 
 
308 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  22.54 
 
 
319 aa  55.8  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  24.6 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  25.78 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  23.53 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  20.85 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  25.85 
 
 
327 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  29.75 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.32 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  25.81 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.65 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.32 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  24.09 
 
 
320 aa  54.3  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  27.48 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>